RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 SPDYE5A6NIY4 337 aa15.72■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 NFIAQ12857 509 aa15.72■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 FKBP1CQ5VVH2 108 aa15.72■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 ERO1AQ96HE7 468 aa15.72■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 MYH2Q9UKX2 1941 aa15.72■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 INPP5BP32019 993 aa15.71■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 IL15P40933 162 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 GTF2A2P52657 109 aa15.71■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 TIMM10P62072 90 aa15.71■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 SP3Q02447 781 aa15.71■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 ZFPM1Q8IX07 1006 aa15.71■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 FBXO3Q9UK99 471 aa15.71■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 PTPN22Q9Y2R2 807 aa15.71■□□□□ 0.11
PRAME-212ENST00000485532 IRF6O14896 467 aa15.7■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 LDHBP07195 334 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 ERO1BQ86YB8 467 aa15.7■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 EFCC1Q9HA90 598 aa15.7■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 COPRSQ9NQ92 184 aa15.7■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 FAM198AQ9UFP1 575 aa15.7■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 BRCA2P51587 3418 aa15.7■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 POTEFA5A3E0 1075 aa15.69■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 BTBD19C9JJ37 291 aa15.69■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 BCAR3O75815 825 aa15.69■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 SLC34A2O95436 690 aa15.69■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 CCDC102BQ68D86 513 aa15.69■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 FAM151AQ8WW52 585 aa15.69■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 ZNF341Q9BYN7 854 aa15.69■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa15.69■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 USP40Q9NVE5 1235 aa15.69■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 SRGAP3O43295 1099 aa15.68■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 SLURP2P0DP57 97 aa15.68■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 TFCP2Q12800 502 aa15.68■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 RASGRF1Q13972 1273 aa15.68■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 DCAF15Q66K64 600 aa15.68■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa15.68■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 DENND2AQ9ULE3 1009 aa15.68■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 SALL1Q9NSC2 1324 aa15.68■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 CETPP11597 493 aa15.67■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 PPIL2Q13356 520 aa15.67■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 ARHGAP45Q92619 1136 aa15.67■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 CLUAP1Q96AJ1 413 aa15.67■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 HOOK2Q96ED9 719 aa15.67■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 DOCK2Q92608 1830 aa15.66■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 A0A1B0GUL7 405 aa15.66■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 SEMA3EO15041 775 aa15.66■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 GNAI3P08754 354 aa15.66■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 TRIM27P14373 513 aa15.66■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 SNAPC2Q13487 334 aa15.66■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 XAGE2Q96GT9 111 aa15.66■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 ABCF2Q9UG63 623 aa15.66■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 ZNF112Q9UJU3 913 aa15.66■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 HDAC5Q9UQL6 1122 aa15.66■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 RGS3P49796 1198 aa15.65■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 PI16Q6UXB8 463 aa15.65■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa15.65■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa15.65■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.1
PRAME-212ENST00000485532 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa15.64■□□□□ 0.09
PRAME-212ENST00000485532 TLR2O60603 784 aa15.64■□□□□ 0.09
PRAME-212ENST00000485532 PPATQ06203 517 aa15.64■□□□□ 0.09
PRAME-212ENST00000485532 MTX1Q13505 466 aa15.64■□□□□ 0.09
PRAME-212ENST00000485532 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
PRAME-212ENST00000485532 ZNF384Q8TF68 577 aa15.64■□□□□ 0.09
PRAME-212ENST00000485532 ARMC5Q96C12 935 aa15.64■□□□□ 0.09
PRAME-212ENST00000485532 NEUROD6Q96NK8 337 aa15.64■□□□□ 0.09
PRAME-212ENST00000485532 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
PRAME-212ENST00000485532 GAKO14976 1311 aa15.64■□□□□ 0.09
PRAME-212ENST00000485532 ATRNL1Q5VV63 1379 aa15.63■□□□□ 0.09
PRAME-212ENST00000485532 MYCP01106 439 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
PRAME-212ENST00000485532 EN2P19622 333 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
PRAME-212ENST00000485532 CTGFP29279 349 aa15.63■□□□□ 0.09
PRAME-212ENST00000485532 MOGSQ13724 837 aa15.63■□□□□ 0.09
PRAME-212ENST00000485532 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
PRAME-212ENST00000485532 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa15.63■□□□□ 0.09
PRAME-212ENST00000485532 CPA4Q9UI42 421 aa15.63■□□□□ 0.09
PRAME-212ENST00000485532 RFX7Q2KHR2 1363 aa15.62■□□□□ 0.09
PRAME-212ENST00000485532 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
PRAME-212ENST00000485532 PHF20L1A8MW92 1017 aa15.62■□□□□ 0.09
PRAME-212ENST00000485532 PDHXO00330 501 aa15.62■□□□□ 0.09
PRAME-212ENST00000485532 BTDP43251 543 aa15.62■□□□□ 0.09
PRAME-212ENST00000485532 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
PRAME-212ENST00000485532 MECOMQ03112 1051 aa15.62■□□□□ 0.09
PRAME-212ENST00000485532 PICALMQ13492 652 aa15.62■□□□□ 0.09
PRAME-212ENST00000485532 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa15.62■□□□□ 0.09
PRAME-212ENST00000485532 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
PRAME-212ENST00000485532 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
PRAME-212ENST00000485532 IDI2Q9BXS1 227 aa15.62■□□□□ 0.09
PRAME-212ENST00000485532 HMG20BQ9P0W2 317 aa15.62■□□□□ 0.09
PRAME-212ENST00000485532 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms