RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480416.1

TNS1-215, Transcript of tensin 1, human

TSL 2

Gene TNS1, Length 335 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNS1-215	ENST00000480416	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TNS1-215	ENST00000480416	FAM177B	A6PVY3	158 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TNS1-215	ENST00000480416	ADM5	C9JUS6	153 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TNS1-215	ENST00000480416	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TNS1-215	ENST00000480416	MTHFS	P49914	203 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TNS1-215	ENST00000480416	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TNS1-215	ENST00000480416	CXCL9	Q07325	125 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TNS1-215	ENST00000480416	SV2A	Q7L0J3	742 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TNS1-215	ENST00000480416		Q7L0L9	218 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TNS1-215	ENST00000480416	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TNS1-215	ENST00000480416	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TNS1-215	ENST00000480416	BANK1	Q8NDB2	785 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TNS1-215	ENST00000480416	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TNS1-215	ENST00000480416	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TNS1-215	ENST00000480416	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TNS1-215	ENST00000480416	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TNS1-215	ENST00000480416	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TNS1-215	ENST00000480416	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TNS1-215	ENST00000480416	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TNS1-215	ENST00000480416	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TNS1-215	ENST00000480416	ESPN	B1AK53	854 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TNS1-215	ENST00000480416	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TNS1-215	ENST00000480416	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TNS1-215	ENST00000480416	PTGIR	P43119	386 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TNS1-215	ENST00000480416	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TNS1-215	ENST00000480416	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TNS1-215	ENST00000480416	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TNS1-215	ENST00000480416	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TNS1-215	ENST00000480416	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TNS1-215	ENST00000480416	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TNS1-215	ENST00000480416	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TNS1-215	ENST00000480416	CNBD1	Q8NA66	436 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TNS1-215	ENST00000480416	IL27	Q8NEV9	243 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TNS1-215	ENST00000480416	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TNS1-215	ENST00000480416	SETDB2	Q96T68	719 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TNS1-215	ENST00000480416	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TNS1-215	ENST00000480416	PRO3102	Q9H379	93 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TNS1-215	ENST00000480416	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TNS1-215	ENST00000480416	TRIM17	Q9Y577	477 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TNS1-215	ENST00000480416	MUC3A	Q02505	3323 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	SLC35F4	A4IF30	521 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	NPHP1	O15259	732 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	RAD17	O75943	681 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	CAMTA2	O94983	1202 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	A1BG	P04217	495 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	NPR1	P16066	1061 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	ITGA6	P23229	1130 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	ST5	P78524	1137 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	AOC3	Q16853	763 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	GMCL1	Q96IK5	515 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	PSMD1	Q99460	953 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	CDC14C	A4D256	554 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	YDJC	A8MPS7	323 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	FKTN	O75072	461 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	GPC1	P35052	558 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	TM4SF4	P48230	202 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	NR1H3	Q13133	447 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	RNF217	Q8TC41	542 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	DPF3	Q92784	378 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	NLRP3	Q96P20	1036 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	CYLD	Q9NQC7	956 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	POLK	Q9UBT6	870 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416		H7C1W4	665 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	PPIP5K2	O43314	1243 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	LILRA1	O75019	489 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	ALDH1B1	P30837	517 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	4.5	□□□□□ -1.69
TNS1-215	ENST00000480416	NIM1K	Q8IY84	436 aa		4.5	□□□□□ -1.69

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