RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409148.1

LRRTM1-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 4 BASIC

Gene LRRTM1, Length 2,126 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM1-202ENST00000409148 GIMAP6Q6P9H5 292 aa20.12■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 RGS22Q8NE09 1264 aa20.12■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 C8orf76Q96K31 380 aa20.12■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 PRKAB2O43741 272 aa20.12■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 ADD1P35611 737 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 CTDSPL2Q05D32 466 aa20.12■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 TRAPPC3LQ5T215 181 aa20.12■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 MFSD6Q6ZSS7 791 aa20.12■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 MIGA1Q8NAN2 632 aa20.12■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 BICD2Q8TD16 824 aa20.12■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 NPHP1O15259 732 aa20.11■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 PPFIA3O75145 1194 aa20.11■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 GUCY1B3Q02153 619 aa20.11■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 HS1BP3Q53T59 392 aa20.11■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 APOA5Q6Q788 366 aa20.11■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 SGMS1Q86VZ5 419 aa20.11■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa20.11■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 STAG1Q8WVM7 1258 aa20.11■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 FUCA2Q9BTY2 467 aa20.11■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.11■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa20.11■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 LIFRP42702 1097 aa20.11■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 TMEM67Q5HYA8 995 aa20.11■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 NFXL1Q6ZNB6 911 aa20.11■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 FBXO33Q7Z6M2 555 aa20.11■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 PGBD1Q96JS3 809 aa20.11■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 RCOR1Q9UKL0 485 aa20.11■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 MAP3K11Q16584 847 aa20.1■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa20.1■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 LY9Q9HBG7 655 aa20.1■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 DACT1Q9NYF0 836 aa20.1■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 CACNA1SQ13698 1873 aa20.1■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 ZBTB43O43298 467 aa20.09■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 KDM4AO75164 1064 aa20.09■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 CCDC192P0DO97 292 aa20.09■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 AMIGO3Q86WK7 504 aa20.09■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 SEPT12Q8IYM1 358 aa20.09■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa20.09■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 SART3Q15020 963 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 NKX2-3Q8TAU0 364 aa20.09■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 MTA3Q9BTC8 594 aa20.09■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 ZSWIM5Q9P217 1185 aa20.09■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 ADRA2BP18089 450 aa20.08■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 FAM196AQ6ZSG2 479 aa20.08■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 ADGRA1Q86SQ6 560 aa20.08■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 FBXO41Q8TF61 875 aa20.08■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 USP28Q96RU2 1077 aa20.08■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 TNMDQ9H2S6 317 aa20.08■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
LRRTM1-202ENST00000409148 CCDC69A6NI79 296 aa20.08■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 BRAPQ7Z569 592 aa20.08■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 PDCL3Q9H2J4 239 aa20.08■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 CLSTN2Q9H4D0 955 aa20.08■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 GOLGA8AA7E2F4 631 aa20.07■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 PPARAQ07869 468 aa20.07■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa20.07■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 MICU3Q86XE3 530 aa20.07■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 CCDC24Q8N4L8 307 aa20.07■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 INCENPQ9NQS7 918 aa20.07■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 TOMM22Q9NS69 142 aa20.07■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 SLC12A7Q9Y666 1083 aa20.07■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 TM4SF1P30408 202 aa20.06■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 ANAPC4Q9UJX5 808 aa20.06■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 ERICH2A1L162 156 aa20.06■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 TACC3Q9Y6A5 838 aa20.06■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 MAST2Q6P0Q8 1798 aa20.05■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 ZBTB22O15209 634 aa20.05■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 CAMK4Q16566 473 aa20.05■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 ZSCAN30Q86W11 494 aa20.05■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 CNBD1Q8NA66 436 aa20.05■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 SDR42E1Q8WUS8 393 aa20.05■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 SENP2Q9HC62 589 aa20.05■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 NID2Q14112 1375 aa20.05■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 NR1I2O75469 434 aa20.05■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 KLRK1P26718 216 aa20.05■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 NFIXQ14938 502 aa20.05■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa20.05■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 TMTC2Q8N394 836 aa20.05■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 ALG1Q9BT22 464 aa20.05■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 BRIP1Q9BX63 1249 aa20.05■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 RTEL1Q9NZ71 1219 aa20.05■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 RXRAP19793 462 aa20.04■□□□□ 0.8
LRRTM1-202ENST00000409148 CDC27P30260 824 aa20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms