RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM67Q5HYA8 995 aa25.39■■□□□ 1.65
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SPHK1-201ENST00000323374 NFXL1Q6ZNB6 911 aa25.39■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP25.39■■□□□ 1.655e-7■□□□□ 8.3
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SPHK1-201ENST00000323374 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa25.38■■□□□ 1.65
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SPHK1-201ENST00000323374 C4BP0C0L5 1744 aa25.36■■□□□ 1.65
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SPHK1-201ENST00000323374 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 TACC3Q9Y6A5 838 aa25.35■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.35■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 SEMA3EO15041 775 aa25.34■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 FBXO33Q7Z6M2 555 aa25.34■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 ANKRD2Q9GZV1 360 aa25.34■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 SLC12A7Q9Y666 1083 aa25.34■■□□□ 1.65
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SPHK1-201ENST00000323374 CDC27P30260 824 aa25.34■■□□□ 1.65
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SPHK1-201ENST00000323374 PCDHA7Q9UN72 937 aa25.3■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 FAM160A1Q05DH4 1040 aa25.29■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 ADALQ6DHV7 355 aa25.29■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 NID2Q14112 1375 aa25.29■■□□□ 1.64
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