RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM67Q5HYA8 995 aa25.39■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 TPTE2Q6XPS3 522 aa25.39■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 NFXL1Q6ZNB6 911 aa25.39■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP25.39■■□□□ 1.655e-7■□□□□ 8.3
SPHK1-201ENST00000323374 LY9Q9HBG7 655 aa25.39■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 LIFRP42702 1097 aa25.38■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa25.38■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 STAG1Q8WVM7 1258 aa25.38■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 INCENPQ9NQS7 918 aa25.38■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 ZSWIM5Q9P217 1185 aa25.38■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 ZBTB43O43298 467 aa25.37■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 KDM4AO75164 1064 aa25.37■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 FAM182BQ5T319 152 aa25.37■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 USP25Q9UHP3 1055 aa25.37■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 A0A1B0GUL6 1792 aa25.37■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 TIAM2Q8IVF5 1701 aa25.37■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 C4AP0C0L4 1744 aa25.36■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 C4BP0C0L5 1744 aa25.36■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 TYRO3Q06418 890 aa25.36■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 BRAPQ7Z569 592 aa25.36■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 CKAP2LQ8IYA6 745 aa25.36■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 SENP2Q9HC62 589 aa25.36■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa25.36■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 MICU3Q86XE3 530 aa25.36■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 RTEL1Q9NZ71 1219 aa25.36■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 CASZ1Q86V15 1759 aa25.35■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 TAF1P21675 1872 aa25.35■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 ADGRA1Q86SQ6 560 aa25.35■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 TACC3Q9Y6A5 838 aa25.35■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.35■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 SEMA3EO15041 775 aa25.34■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 FBXO33Q7Z6M2 555 aa25.34■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 ANKRD2Q9GZV1 360 aa25.34■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 SLC12A7Q9Y666 1083 aa25.34■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 MRVI1Q9Y6F6 885 aa25.34■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 CCDC69A6NI79 296 aa25.34■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 GOLGA8AA7E2F4 631 aa25.34■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 RXRAP19793 462 aa25.34■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 CDC27P30260 824 aa25.34■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 FAM200AQ8TCP9 573 aa25.34■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 ADCY5O95622 1261 aa25.33■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 PTMAP06454 111 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 ME1P48163 572 aa25.33■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 SART3Q15020 963 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 MTA3Q9BTC8 594 aa25.33■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 TOMM22Q9NS69 142 aa25.33■■□□□ 1.65
SPHK1-201ENST00000323374 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa25.33■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa25.33■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 ALG1Q9BT22 464 aa25.33■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 PPARAQ07869 468 aa25.32■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa25.32■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 CHD4Q14839 1912 aa25.31■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 MYSM1Q5VVJ2 828 aa25.31■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 SASS6Q6UVJ0 657 aa25.31■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.31■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa25.31■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 GJB4Q9NTQ9 266 aa25.31■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 CTAGE5O15320 804 aa25.31■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 RFC4P35249 363 aa25.31■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 IARSP41252 1262 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 NTRK3Q16288 839 aa25.31■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 SDR42E1Q8WUS8 393 aa25.31■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 POLR3EQ9NVU0 708 aa25.31■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 ERICH2A1L162 156 aa25.3■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 YEATS4O95619 227 aa25.3■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 TRAPPC3LQ5T215 181 aa25.3■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 CCDC24Q8N4L8 307 aa25.3■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 LINC00301Q8NCQ3 95 aa25.3■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 KCNG4Q8TDN1 519 aa25.3■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa25.3■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 ANAPC4Q9UJX5 808 aa25.3■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 NPHP1O15259 732 aa25.3■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 WTAPQ15007 396 aa25.3■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 STK38Q15208 465 aa25.3■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 TMTC2Q8N394 836 aa25.3■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 PHKBQ93100 1093 aa25.3■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 MYL10Q9BUA6 226 aa25.3■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 PCDHA7Q9UN72 937 aa25.3■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 FAM160A1Q05DH4 1040 aa25.29■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 ADALQ6DHV7 355 aa25.29■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 NID2Q14112 1375 aa25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.3 ms