RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580646.5

GGA3-209, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 829 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-209ENST00000580646 MT-CO2P00403 227 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 SLC25A4P12235 298 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 S100A2P29034 98 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 ARL3P36405 182 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 NPBWR1P48145 328 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 MFAP4P55083 255 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 RAB11AP62491 216 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 CYCSP99999 105 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 RPEL1Q2QD12 228 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 C9orf66Q5T8R8 295 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 CLEC19AQ6UXS0 136 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 GPHB5Q86YW7 130 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 TMEM170AQ8WVE7 144 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 CACNG8Q8WXS5 425 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 C14orf144Q96I85 54 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 SMCO4Q9NRQ5 59 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 C15orf62A8K5M9 175 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 SEC14L6B5MCN3 397 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 LGALS9O00182 355 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 OVOL1O14753 267 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 SCGB2A1O75556 95 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 TRBV12-3P01733 135 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 MBPP02686 304 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 CLEC3BP05452 202 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 OPRK1P41145 380 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 INSL3P51460 131 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 SLURP1P55000 103 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 CD69Q07108 199 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 TMEM116Q8NCL8 245 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 BPIFCQ8NFQ6 507 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 OR4X1Q8NH49 305 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 DCUN1D4Q92564 292 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 MAGT1Q9H0U3 335 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 GSKIPQ9P0R6 139 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 A8MWP6 167 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 PRSS46E5RG02 174 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 PPP5D1E7EU14 171 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 K7EPK0 472 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 NDUFA4O00483 81 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 GOSR2O14653 212 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 SSSCA1O60232 199 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 SCGB1D2O95969 90 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 IGHV3-23P01764 117 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 CTSGP08311 255 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 IAPPP10997 89 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 GPR183P32249 361 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 ELLP55199 621 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 PAX9P55771 341 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 NHLH2Q02577 135 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 GAGE1Q13065 139 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 FAM106AQ4KMX7 169 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 Q56UQ5 140 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 ACSM6Q6P461 480 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 TMUB2Q71RG4 321 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 RXFP4Q8TDU9 374 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 C11orf1Q9H5F2 150 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 PSENENQ9NZ42 101 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 PEMTQ9UBM1 199 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 S4R3C0 116 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 OR2T8A6NH00 312 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 FNDC10F2Z333 226 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 GNG7O60262 68 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 TMEM50AO95807 157 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 MT-ND4LP03901 98 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 DDTP30046 118 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 ADMP35318 185 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 H2BFSP57053 126 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 FABP9Q0Z7S8 132 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 SPANXN5Q5MJ07 72 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 FAM74A1Q5RGS3 127 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 C11orf87Q6NUJ2 197 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 PRSS54Q6PEW0 395 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 OR9G4Q8NGQ1 327 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 OR4C12Q96R67 309 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 ELOVL1Q9BW60 279 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 SEC11CQ9BY50 192 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 MGAT4CQ9UBM8 478 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 SORL1Q92673 2214 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 DNAH9Q9NYC9 4486 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 A0A0D9SG52 128 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 PMS2P5A8MQ11 134 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-209ENST00000580646 CIDEAO60543 219 aa7.53□□□□□ -1.2
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