RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 BATF3Q9NR55 127 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 PTTG2Q9NZH5 202 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 MPTX1A8MV57 137 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 SYNGR2O43760 224 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 IGLC1P0CG04 106 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 OR10J1P30954 320 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 OR1S2Q8NGQ3 325 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 APOHP02749 345 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 NPPCP23582 126 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 RAB11AP62491 216 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 ID3Q02535 119 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF846Q147U1 533 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 HAGHQ16775 308 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 Q8WTZ3 238 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 MITD1Q8WV92 249 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 ACY3Q96HD9 319 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 SRD5A3Q9H8P0 318 aa15.78■□□□□ 0.12
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SH3BP4-204ENST00000416021 TRAV6A0A075B6T7 132 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 WRBO00258 174 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 RPP30P78346 268 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 LILRB2Q8N423 598 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 TM2D3Q9BRN9 247 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 BMI1P35226 326 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM90A2PQ658T7 463 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 MZT2BQ6NZ67 158 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 ST8SIA2Q92186 375 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 RCHY1Q96PM5 261 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 VSIRQ9H7M9 311 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 TBC1D24Q9ULP9 559 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 H2AFB2P0C5Z0 115 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 GAMTQ14353 236 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 OR4D5Q8NGN0 318 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 METTL26Q96S19 204 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 NUDT15Q9NV35 164 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A1W2PS18 150 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 OR4C46A6NHA9 309 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 UPK1BO75841 260 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 CD5P06127 495 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 RD3LP0DJH9 198 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 CRYBB3P26998 211 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 ASAH1Q13510 395 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 TCF24Q7RTU0 167 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 UBQLN2Q9UHD9 624 aa15.74■□□□□ 0.11
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SH3BP4-204ENST00000416021 TFPI2P48307 235 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
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SH3BP4-204ENST00000416021 SLC35E1Q96K37 410 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM231Q9H6L2 316 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 GSKIPQ9P0R6 139 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 TOMM40O96008 361 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 PAFAH1B2P68402 229 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 GBGT1Q8N5D6 347 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 CITED4Q96RK1 184 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 SPATA25Q9BR10 227 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 SEC22CQ9BRL7 303 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 ZFP92A6NM28 416 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 PSG1P11464 419 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 RPL11P62913 178 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 IFITM3Q01628 133 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 PSENENQ9NZ42 101 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 IL4P05112 153 aa15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 ODF3L2Q3SX64 289 aa15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 WFDC3Q8IUB2 231 aa15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 SMIM8Q96KF7 97 aa15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM110AQ9BQ89 295 aa15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 U3KQE9 123 aa15.7■□□□□ 0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 H3BP45 60 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 SSSCA1O60232 199 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 SCGB1D2O95969 90 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP15.69■□□□□ 0.11e-6■□□□□ 10.4
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF90Q03938 601 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 MS4A6AQ9H2W1 248 aa15.69■□□□□ 0.1
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