RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028157.8

Gtf3c5-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c5, Length 2,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Q6DIA7 600 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 C330021F23RikQ8C7T0 141 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ccnl2Q9JJA7 518 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rpl23a-ps3A0A140T8M7 156 aa11.39□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr918E9PVZ7 325 aa11.39□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm21719J3KMI9 230 aa11.39□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sult2a5K7N6K9 285 aa11.39□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gpr33O88416 339 aa11.39□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ppt1O88531 306 aa11.39□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Asgr2P24721 301 aa11.39□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rpl23aP62751 156 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cdk2P97377 346 aa11.39□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm9Q3UKW5 162 aa11.39□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Q6PIU9 354 aa11.39□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fam212bQ80VY2 300 aa11.39□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lcn10Q810Z1 182 aa11.39□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ssxb2Q8C5Z3 165 aa11.39□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr860Q8VFF7 317 aa11.39□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fbp1Q9QXD6 338 aa11.39□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Aifm1Q9Z0X1 612 aa11.39□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr902E9Q6Z7 309 aa11.39□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Prkar2aP12367 401 aa11.39□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lbx1P52955 282 aa11.39□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Btn1a1Q62556 524 aa11.39□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr484Q8VFD3 321 aa11.39□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr126Q8VGF0 319 aa11.39□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rab40cQ8VHQ4 281 aa11.39□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 PkdrejQ9Z0T6 2126 aa11.39□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Arl16B1ATY8 173 aa11.38□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm20877J3QPZ4 227 aa11.38□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr906K7N5P3 311 aa11.38□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ifna6P07350 189 aa11.38□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fcer1gP20491 86 aa11.38□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Klhl8P59280 629 aa11.38□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hist1h2baP70696 127 aa11.38□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sdr39u1Q5M8N4 308 aa11.38□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sfxn3Q91V61 321 aa11.38□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lmntd1Q9D4C1 413 aa11.38□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ube2j1Q9JJZ4 318 aa11.38□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Crim1Q9JLL0 1037 aa11.38□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sult1b1Q9QWG7 299 aa11.38□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Med12lQ8BQM9 2157 aa11.38□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trav18A0A075B656 109 aa11.38□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trbv5A0A0B4J1G9 113 aa11.38□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm5890A0A140LI04 305 aa11.38□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr789A0A1L1SV77 312 aa11.38□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm17669F6QL70 154 aa11.38□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Q3UZV7 1028 aa11.38□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr129Q8VEY1 330 aa11.38□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr480Q8VEZ0 312 aa11.38□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr508Q8VG42 310 aa11.38□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Prr15Q9D1T5 122 aa11.38□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Herpud1Q9JJK5 391 aa11.38□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 St6galnac3Q9WUV2 305 aa11.38□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm3486L7N2D0 199 aa11.37□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 EnkurQ6SP97 255 aa11.37□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Smap2Q7TN29 428 aa11.37□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sdhaf2Q8C6I2 164 aa11.37□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1141Q8VFQ7 311 aa11.37□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mpped1Q91ZG2 326 aa11.37□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 GgactQ923B0 149 aa11.37□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tmem100Q9CQG9 134 aa11.37□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 3100002H09RikQ9CXW6 140 aa11.37□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Coa3Q9D2R6 108 aa11.37□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fam210bQ9D8B6 190 aa11.37□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Icam4Q9ERM2 262 aa11.37□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr573-ps1A0A1B0GRU2 297 aa11.37□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr467L7N455 308 aa11.37□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ninj1O70131 152 aa11.37□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hist1h1eP43274 219 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm10840Q3V2K9 103 aa11.37□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Prdx2Q61171 198 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1444Q8VFX2 319 aa11.37□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 HaghQ99KB8 309 aa11.37□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mrpl51Q9CPY1 128 aa11.37□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sumo3Q9Z172 110 aa11.37□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm3045A0A1D5RMA1 209 aa11.37□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr920E9Q413 310 aa11.37□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm15130F6PYN5 206 aa11.37□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1329L7MTV4 313 aa11.37□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tnfrsf1aP25118 454 aa11.37□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Defa11P50709 85 aa11.37□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Isoc2aP85094 206 aa11.37□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm614Q3V2K1 191 aa11.37□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1362Q5SZZ8 308 aa11.37□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Npy4rQ61041 375 aa11.37□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ell3Q80VR2 395 aa11.37□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pla2g16Q8R3U1 162 aa11.37□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dkk4Q8VEJ3 221 aa11.37□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Glo1Q9CPU0 184 aa11.37□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sp5Q9JHX2 398 aa11.37□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ighv9-2A0A0B4J1J4 117 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm17333C6EQI3 125 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 A930017K11RikE0CXQ2 571 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Wt1P22561 449 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Neurog3P70661 214 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 CxadrP97792 365 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trav8d-1Q5R1H8 112 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Spock1Q62288 442 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr907Q7TRC7 310 aa11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15 ms