Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R6

Coa3, Cytochrome c oxidase assembly factor 3 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Coa3Q9D2R6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Coa3Q9D2R6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Coa3Q9D2R6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Coa3Q9D2R6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Coa3Q9D2R6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Coa3Q9D2R6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Coa3Q9D2R6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Coa3Q9D2R6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Coa3Q9D2R6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Coa3Q9D2R6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Coa3Q9D2R6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Coa3Q9D2R6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Coa3Q9D2R6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Coa3Q9D2R6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Coa3Q9D2R6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Coa3Q9D2R6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Coa3Q9D2R6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Coa3Q9D2R6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Coa3Q9D2R6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Coa3Q9D2R6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Coa3Q9D2R6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Coa3Q9D2R6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Coa3Q9D2R6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Coa3Q9D2R6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Coa3Q9D2R6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Coa3Q9D2R6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Coa3Q9D2R6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Coa3Q9D2R6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Coa3Q9D2R6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Coa3Q9D2R6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Coa3Q9D2R6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Coa3Q9D2R6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Coa3Q9D2R6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Coa3Q9D2R6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Coa3Q9D2R6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Coa3Q9D2R6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Coa3Q9D2R6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Coa3Q9D2R6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Coa3Q9D2R6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Coa3Q9D2R6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Coa3Q9D2R6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Coa3Q9D2R6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Coa3Q9D2R6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Coa3Q9D2R6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Coa3Q9D2R6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Coa3Q9D2R6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Coa3Q9D2R6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Coa3Q9D2R6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Coa3Q9D2R6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Coa3Q9D2R6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Coa3Q9D2R6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Coa3Q9D2R6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Coa3Q9D2R6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Coa3Q9D2R6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Coa3Q9D2R6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Coa3Q9D2R6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Coa3Q9D2R6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Coa3Q9D2R6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Coa3Q9D2R6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Coa3Q9D2R6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Coa3Q9D2R6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Coa3Q9D2R6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Coa3Q9D2R6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Coa3Q9D2R6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Coa3Q9D2R6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Coa3Q9D2R6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Coa3Q9D2R6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Coa3Q9D2R6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Coa3Q9D2R6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Coa3Q9D2R6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Coa3Q9D2R6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Coa3Q9D2R6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Coa3Q9D2R6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Coa3Q9D2R6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Coa3Q9D2R6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Coa3Q9D2R6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Coa3Q9D2R6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Coa3Q9D2R6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Coa3Q9D2R6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Coa3Q9D2R6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Coa3Q9D2R6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Coa3Q9D2R6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Coa3Q9D2R6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Coa3Q9D2R6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Coa3Q9D2R6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Coa3Q9D2R6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Coa3Q9D2R6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Coa3Q9D2R6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Coa3Q9D2R6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Coa3Q9D2R6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Coa3Q9D2R6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Coa3Q9D2R6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Coa3Q9D2R6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Coa3Q9D2R6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Coa3Q9D2R6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Coa3Q9D2R6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Coa3Q9D2R6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Coa3Q9D2R6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Coa3Q9D2R6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Coa3Q9D2R6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.8 ms