Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z3

Ssxb2, Synovial sarcoma, X member B2, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb2Q8C5Z3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Ssxb2Q8C5Z3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ssxb2Q8C5Z3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ssxb2Q8C5Z3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ssxb2Q8C5Z3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ssxb2Q8C5Z3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ssxb2Q8C5Z3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ssxb2Q8C5Z3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ssxb2Q8C5Z3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ssxb2Q8C5Z3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ssxb2Q8C5Z3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ssxb2Q8C5Z3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ssxb2Q8C5Z3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ssxb2Q8C5Z3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ssxb2Q8C5Z3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ssxb2Q8C5Z3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ssxb2Q8C5Z3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ssxb2Q8C5Z3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ssxb2Q8C5Z3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ssxb2Q8C5Z3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ssxb2Q8C5Z3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ssxb2Q8C5Z3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ssxb2Q8C5Z3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ssxb2Q8C5Z3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ssxb2Q8C5Z3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ssxb2Q8C5Z3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ssxb2Q8C5Z3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ssxb2Q8C5Z3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ssxb2Q8C5Z3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ssxb2Q8C5Z3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ssxb2Q8C5Z3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ssxb2Q8C5Z3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ssxb2Q8C5Z3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ssxb2Q8C5Z3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ssxb2Q8C5Z3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ssxb2Q8C5Z3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ssxb2Q8C5Z3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ssxb2Q8C5Z3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ssxb2Q8C5Z3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ssxb2Q8C5Z3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ssxb2Q8C5Z3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ssxb2Q8C5Z3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ssxb2Q8C5Z3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ssxb2Q8C5Z3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssxb2Q8C5Z3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssxb2Q8C5Z3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssxb2Q8C5Z3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ssxb2Q8C5Z3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ssxb2Q8C5Z3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ssxb2Q8C5Z3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssxb2Q8C5Z3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ssxb2Q8C5Z3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ssxb2Q8C5Z3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ssxb2Q8C5Z3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ssxb2Q8C5Z3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ssxb2Q8C5Z3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ssxb2Q8C5Z3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ssxb2Q8C5Z3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ssxb2Q8C5Z3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ssxb2Q8C5Z3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ssxb2Q8C5Z3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ssxb2Q8C5Z3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ssxb2Q8C5Z3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ssxb2Q8C5Z3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ssxb2Q8C5Z3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssxb2Q8C5Z3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssxb2Q8C5Z3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssxb2Q8C5Z3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssxb2Q8C5Z3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssxb2Q8C5Z3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ssxb2Q8C5Z3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssxb2Q8C5Z3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ssxb2Q8C5Z3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ssxb2Q8C5Z3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ssxb2Q8C5Z3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ssxb2Q8C5Z3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ssxb2Q8C5Z3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ssxb2Q8C5Z3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ssxb2Q8C5Z3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ssxb2Q8C5Z3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssxb2Q8C5Z3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssxb2Q8C5Z3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ssxb2Q8C5Z3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ssxb2Q8C5Z3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssxb2Q8C5Z3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssxb2Q8C5Z3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssxb2Q8C5Z3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssxb2Q8C5Z3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssxb2Q8C5Z3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ssxb2Q8C5Z3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssxb2Q8C5Z3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssxb2Q8C5Z3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssxb2Q8C5Z3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssxb2Q8C5Z3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ssxb2Q8C5Z3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssxb2Q8C5Z3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssxb2Q8C5Z3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ssxb2Q8C5Z3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ssxb2Q8C5Z3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssxb2Q8C5Z3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
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