Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Defa11P50709 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Defa11P50709 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Defa11P50709 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Defa11P50709 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Defa11P50709 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Defa11P50709 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Defa11P50709 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Defa11P50709 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Defa11P50709 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Defa11P50709 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Defa11P50709 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Defa11P50709 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Defa11P50709 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Defa11P50709 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Defa11P50709 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Defa11P50709 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Defa11P50709 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Defa11P50709 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Defa11P50709 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Defa11P50709 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Defa11P50709 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Defa11P50709 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Defa11P50709 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Defa11P50709 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Defa11P50709 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Defa11P50709 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Defa11P50709 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Defa11P50709 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Defa11P50709 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Defa11P50709 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Defa11P50709 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Defa11P50709 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Defa11P50709 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Defa11P50709 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Defa11P50709 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Defa11P50709 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Defa11P50709 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Defa11P50709 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Defa11P50709 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Defa11P50709 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Defa11P50709 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Defa11P50709 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Defa11P50709 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Defa11P50709 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Defa11P50709 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Defa11P50709 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Defa11P50709 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Defa11P50709 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Defa11P50709 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Defa11P50709 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Defa11P50709 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Defa11P50709 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Defa11P50709 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Defa11P50709 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Defa11P50709 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Defa11P50709 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Defa11P50709 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Defa11P50709 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Defa11P50709 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Defa11P50709 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Defa11P50709 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Defa11P50709 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Defa11P50709 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Defa11P50709 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Defa11P50709 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Defa11P50709 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Defa11P50709 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Defa11P50709 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Defa11P50709 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Defa11P50709 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Defa11P50709 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Defa11P50709 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Defa11P50709 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Defa11P50709 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Defa11P50709 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Defa11P50709 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Defa11P50709 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Defa11P50709 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Defa11P50709 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Defa11P50709 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Defa11P50709 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Defa11P50709 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Defa11P50709 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Defa11P50709 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Defa11P50709 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Defa11P50709 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Defa11P50709 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Defa11P50709 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Defa11P50709 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Defa11P50709 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Defa11P50709 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Defa11P50709 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Defa11P50709 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Defa11P50709 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Defa11P50709 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Defa11P50709 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Defa11P50709 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Defa11P50709 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Defa11P50709 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms