Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJK5

Herpud1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herpud1Q9JJK5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Herpud1Q9JJK5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Herpud1Q9JJK5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Herpud1Q9JJK5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Herpud1Q9JJK5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Herpud1Q9JJK5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Herpud1Q9JJK5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Herpud1Q9JJK5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Herpud1Q9JJK5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Herpud1Q9JJK5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Herpud1Q9JJK5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Herpud1Q9JJK5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Herpud1Q9JJK5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Herpud1Q9JJK5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Herpud1Q9JJK5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Herpud1Q9JJK5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Herpud1Q9JJK5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Herpud1Q9JJK5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Herpud1Q9JJK5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Herpud1Q9JJK5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Herpud1Q9JJK5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Herpud1Q9JJK5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Herpud1Q9JJK5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Herpud1Q9JJK5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Herpud1Q9JJK5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Herpud1Q9JJK5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Herpud1Q9JJK5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Herpud1Q9JJK5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Herpud1Q9JJK5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Herpud1Q9JJK5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Herpud1Q9JJK5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Herpud1Q9JJK5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Herpud1Q9JJK5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Herpud1Q9JJK5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Herpud1Q9JJK5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Herpud1Q9JJK5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Herpud1Q9JJK5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Herpud1Q9JJK5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Herpud1Q9JJK5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Herpud1Q9JJK5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Herpud1Q9JJK5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Herpud1Q9JJK5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Herpud1Q9JJK5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Herpud1Q9JJK5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Herpud1Q9JJK5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Herpud1Q9JJK5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Herpud1Q9JJK5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Herpud1Q9JJK5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Herpud1Q9JJK5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Herpud1Q9JJK5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Herpud1Q9JJK5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Herpud1Q9JJK5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Herpud1Q9JJK5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Herpud1Q9JJK5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Herpud1Q9JJK5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Herpud1Q9JJK5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Herpud1Q9JJK5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Herpud1Q9JJK5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Herpud1Q9JJK5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Herpud1Q9JJK5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Herpud1Q9JJK5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Herpud1Q9JJK5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Herpud1Q9JJK5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Herpud1Q9JJK5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Herpud1Q9JJK5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Herpud1Q9JJK5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Herpud1Q9JJK5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Herpud1Q9JJK5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Herpud1Q9JJK5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Herpud1Q9JJK5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Herpud1Q9JJK5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Herpud1Q9JJK5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Herpud1Q9JJK5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Herpud1Q9JJK5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Herpud1Q9JJK5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Herpud1Q9JJK5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Herpud1Q9JJK5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Herpud1Q9JJK5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Herpud1Q9JJK5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Herpud1Q9JJK5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Herpud1Q9JJK5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Herpud1Q9JJK5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Herpud1Q9JJK5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Herpud1Q9JJK5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Herpud1Q9JJK5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Herpud1Q9JJK5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Herpud1Q9JJK5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Herpud1Q9JJK5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Herpud1Q9JJK5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Herpud1Q9JJK5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Herpud1Q9JJK5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Herpud1Q9JJK5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Herpud1Q9JJK5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Herpud1Q9JJK5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Herpud1Q9JJK5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Herpud1Q9JJK5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Herpud1Q9JJK5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Herpud1Q9JJK5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Herpud1Q9JJK5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Herpud1Q9JJK5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms