RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-217ENST00000583667 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
GGA3-217ENST00000583667 WT1-ASQ06250 92 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-217ENST00000583667 PJVKQ0ZLH3 352 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-217ENST00000583667 C5orf64Q2M2E5 130 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-217ENST00000583667 SPINK9Q5DT21 86 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-217ENST00000583667 FAM74A1Q5RGS3 127 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-217ENST00000583667 OR8G2PQ6IF36 304 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-217ENST00000583667 ZNF562Q6V9R5 426 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-217ENST00000583667 LILRB2Q8N423 598 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-217ENST00000583667 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
GGA3-217ENST00000583667 C17orf50Q8WW18 174 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-217ENST00000583667 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.89
GGA3-217ENST00000583667 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
GGA3-217ENST00000583667 PARP11Q9NR21 331 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-217ENST00000583667 TPSG1Q9NRR2 321 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-217ENST00000583667 KIAA1456Q9P272 454 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-217ENST00000583667 WDR83OSQ9Y284 106 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-217ENST00000583667 A0A1W2PRD5 423 aa9.46□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 A0A1W2PRF3 423 aa9.46□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 A0A1W2PRM7 423 aa9.46□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 IGLC7A0M8Q6 106 aa9.46□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 FBXO24O75426 580 aa9.46□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 S100A1P23297 94 aa9.46□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 SNCAP37840 140 aa9.46□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 MMDQ15546 238 aa9.46□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa9.46□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 FBXL15Q9H469 300 aa9.46□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 NPVFQ9HCQ7 196 aa9.46□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 TEX22C9J3V5 150 aa9.45□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 FCN1O00602 326 aa9.45□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 FSHBP01225 129 aa9.45□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 IFNA4P05014 189 aa9.45□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 BTNL8Q6UX41 500 aa9.45□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 OR10W1Q8NGF6 305 aa9.45□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 HINT2Q9BX68 163 aa9.45□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 SH3BGRL3Q9H299 93 aa9.45□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 RAB19A4D1S5 217 aa9.44□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 AVPP01185 164 aa9.44□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 HLA-DRB1P01911 266 aa9.44□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 OPN1MWP04001 364 aa9.44□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 CRYGCP07315 174 aa9.44□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 OPN1MW2P0DN77 364 aa9.44□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 OPN1MW3P0DN78 364 aa9.44□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 OR13C7P0DN81 318 aa9.44□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 TMEM11P17152 192 aa9.44□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 CD69Q07108 199 aa9.44□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 TNXAQ16473 311 aa9.44□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 TUSC1Q2TAM9 212 aa9.44□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 KLK9Q2XQG4 91 aa9.44□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 SLC25A24Q6NUK1 477 aa9.44□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 C9orf139Q6ZV77 190 aa9.44□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 OR1L6Q8NGR2 347 aa9.44□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 OR1P1Q8NH06 330 aa9.44□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 PIFOQ8TCI5 191 aa9.44□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 P2RX4Q99571 388 aa9.44□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 PFDN2Q9UHV9 154 aa9.44□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 KLK9Q9UKQ9 250 aa9.44□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa9.43□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 TRAV40A0A0B4J280 105 aa9.43□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 MFSD2BA6NFX1 497 aa9.43□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 C17orf112F2Z3M2 114 aa9.43□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 CORTO00230 105 aa9.43□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 MBP02144 154 aa9.43□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 FBP1P09467 338 aa9.43□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa9.43□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 HES1Q14469 280 aa9.43□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 HNF4GQ14541 408 aa9.43□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 C10orf55Q5SWW7 151 aa9.43□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 TMEM144Q7Z5S9 345 aa9.43□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 COMMD1Q8N668 190 aa9.43□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 Q8N9W7 124 aa9.43□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 MARC2Q969Z3 335 aa9.43□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 CXorf58Q96LI9 332 aa9.43□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 FBXO7Q9Y3I1 522 aa9.43□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 TNCP24821 2201 aa9.43□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 A0A0U1RQK1 487 aa9.42□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 BTBD17A6NE02 478 aa9.42□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 CTRB1P17538 263 aa9.42□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 CD24P25063 80 aa9.42□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 OPRK1P41145 380 aa9.42□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 CX3CL1P78423 397 aa9.42□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 RUNX1Q01196 453 aa9.42□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 PMS2P11Q13670 270 aa9.42□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 FXYD3Q14802 87 aa9.42□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 PLGLAQ15195 96 aa9.42□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 PXDC1Q5TGL8 231 aa9.42□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 CTRB2Q6GPI1 263 aa9.42□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 ETFRF1Q6IPR1 90 aa9.42□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 TEPPQ6URK8 271 aa9.42□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 UQCC3Q6UW78 93 aa9.42□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 IL34Q6ZMJ4 242 aa9.42□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 COMMD7Q86VX2 200 aa9.42□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 TEX29Q8N6K0 151 aa9.42□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 ZNF709Q8N972 641 aa9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105.6 ms