RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 OR4C16Q8NGL9 310 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 OR1S2Q8NGQ3 325 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 ATP5SQ99766 215 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 RNF5Q99942 180 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 RSG1Q9BU20 258 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF747Q9BV97 191 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 ARV1Q9H2C2 271 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 NAA60Q9H7X0 242 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF581Q9P0T4 197 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 A8MXK9 166 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 AGPAT2O15120 278 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 AMY1AP04745 511 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 DEFB130BP0DP73 79 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 DEFB130AP0DP74 79 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 S100A1P23297 94 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 TSPOP30536 169 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00205P59089 165 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM187Q14656 261 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 Q6P435 159 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 REC114Q7Z4M0 266 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 HOGA1Q86XE5 327 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 OR11H6Q8NGC7 330 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 BOLA1Q9Y3E2 137 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 PLXNB1O43157 2135 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 PPP5D1E7EU14 171 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 MFNGO00587 321 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 RGS13O14921 159 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 CCNKO75909 580 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 HBE1P02100 147 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 TCRBP04435 133 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 SMIM17P0DL12 118 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 SLC25A6P12236 298 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 SPNP16150 400 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 OR10J1P30954 320 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 TAS2R30P59541 319 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 FOXE3Q13461 319 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 LEMD1Q68G75 181 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 FAM89BQ8N5H3 189 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM116Q8NCL8 245 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 RNF141Q8WVD5 230 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM63Q969Q1 353 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 PLEKHA2Q9HB19 425 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 VWC2LB2RUY7 222 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 CA1P00915 261 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 LYL1P12980 280 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 INSL3P51460 131 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 SPCS3P61009 180 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 UBE2G1P62253 170 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 ASCL4Q6XD76 172 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF600Q6ZNG1 722 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM229BQ8NBD8 167 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 PRR13Q9NZ81 148 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 HIGD1AQ9Y241 93 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 H0YJW9 148 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 SYNGR2O43760 224 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 LY6G6CO95867 125 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 LHBP01229 141 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 FGF7P21781 194 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 MAS1LP35410 378 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 FAM76BQ5HYJ3 339 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 SIGIRRQ6IA17 410 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 PRIMA1Q86XR5 153 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 RARRES2Q99969 163 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 UQCC1Q9NVA1 299 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 XCL2Q9UBD3 114 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 TENM4Q6N022 2769 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0B4J293 547 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 PSCAO43653 123 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 TSPAN15O95858 294 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 NUDT3O95989 172 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 SLC25A4P12235 298 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 MFAP2P55001 183 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 FXYD7P58549 80 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 CRIP3Q6Q6R5 217 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 SRD5A3Q9H8P0 318 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 FLVCR2Q9UPI3 526 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 A6NDX4 124 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 F5H768 121 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 H3BTX0 84 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 SSX5O60225 188 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 IGKV1-16P04430 117 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 FOLR2P14207 255 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 RPL7P18124 248 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 SLC6A1P30531 599 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM128Q5BJH2 165 aa3.53□□□□□ -1.84
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