RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460120.5

HPS3-202, Transcript of HPS3, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HPS3, Length 2,745 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3-202ENST00000460120 SFRP2Q96HF1 295 aa14.79□□□□□ -0.04
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HPS3-202ENST00000460120 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa14.79□□□□□ -0.04
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HPS3-202ENST00000460120 VENTXO95231 258 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 TNFRSF1AP19438 455 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 TMPRSS3P57727 454 aa14.79□□□□□ -0.04
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HPS3-202ENST00000460120 ADTRPQ96IZ2 230 aa14.78□□□□□ -0.04
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HPS3-202ENST00000460120 REG1AP05451 166 aa14.77□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 NUBP1P53384 320 aa14.77□□□□□ -0.04
HPS3-202ENST00000460120 PRCDQ00LT1 54 aa14.77□□□□□ -0.04
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HPS3-202ENST00000460120 PPIAL4DF5H284 164 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 GGCTO75223 188 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 LINC00869P0C866 280 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 PPIAL4FP0DN26 164 aa14.76□□□□□ -0.05
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HPS3-202ENST00000460120 IMMP2LQ96T52 175 aa14.76□□□□□ -0.05
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HPS3-202ENST00000460120 PRDM13Q9H4Q3 707 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 DYNLRB1Q9NP97 96 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 PPIAL4AQ9Y536 164 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 K7EN84 100 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 ITGB1BP1O14713 200 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 SFTPCP11686 197 aa14.76□□□□□ -0.05
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HPS3-202ENST00000460120 C3orf36Q3SXR2 165 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa14.75□□□□□ -0.05
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HPS3-202ENST00000460120 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 TPSG1Q9NRR2 321 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 CTSZQ9UBR2 303 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 CUL9Q8IWT3 2517 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 DVL1O14640 695 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 CASP6P55212 293 aa14.74□□□□□ -0.05
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HPS3-202ENST00000460120 PRR20DP86480 221 aa14.74□□□□□ -0.05
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HPS3-202ENST00000460120 PRR20AP86496 221 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 MORN5Q5VZ52 161 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 C19orf35Q6ZS72 473 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 OR10G8Q8NGN5 311 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 RITA1Q96K30 269 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 SPTA1P02549 2419 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 H0YJW9 148 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 TMEM178BH3BS89 294 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 NDUFB3O43676 98 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 TDGF1P3P51864 188 aa14.73□□□□□ -0.05
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HPS3-202ENST00000460120 SLC35B1P78383 322 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 TMEM106BQ9NUM4 274 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 SLC45A2Q9UMX9 530 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 PLXNB1O43157 2135 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 NBASA2RRP1 2371 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 CBLN1P23435 193 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS3-202ENST00000460120 ZNF90Q03938 601 aa14.73□□□□□ -0.05
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