RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGFBP2P18065 325 aa13.96□□□□□ -0.18
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.18
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa13.95□□□□□ -0.18
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GFRA1P56159 465 aa13.95□□□□□ -0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa13.95□□□□□ -0.18
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM189A5PLL7 270 aa13.95□□□□□ -0.18
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IQCF6A8MYZ5 107 aa13.91□□□□□ -0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCL20P78556 96 aa13.91□□□□□ -0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FOXF2Q12947 444 aa13.91□□□□□ -0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP13.91□□□□□ -0.185e-8■■■■□ 22
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa13.91□□□□□ -0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGKV3-15P01624 115 aa13.91□□□□□ -0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF738Q8NE65 137 aa13.91□□□□□ -0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF581Q9P0T4 197 aa13.91□□□□□ -0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SCO2A0A1W2PP80 73 aa13.91□□□□□ -0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SELLP14151 372 aa13.91□□□□□ -0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 B9A039 149 aa13.9□□□□□ -0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LYNX1G3V0Z9 82 aa13.9□□□□□ -0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LEPROTL1O95214 131 aa13.9□□□□□ -0.18
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