Protein–RNA interactions for Protein: Q9P283

SEMA5B, Semaphorin-5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5BQ9P283 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SEMA5BQ9P283 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SEMA5BQ9P283 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SEMA5BQ9P283 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SEMA5BQ9P283 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SEMA5BQ9P283 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SEMA5BQ9P283 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
SEMA5BQ9P283 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SEMA5BQ9P283 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SEMA5BQ9P283 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SEMA5BQ9P283 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SEMA5BQ9P283 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SEMA5BQ9P283 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SEMA5BQ9P283 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SEMA5BQ9P283 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SEMA5BQ9P283 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SEMA5BQ9P283 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SEMA5BQ9P283 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SEMA5BQ9P283 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SEMA5BQ9P283 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SEMA5BQ9P283 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SEMA5BQ9P283 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SEMA5BQ9P283 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SEMA5BQ9P283 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SEMA5BQ9P283 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SEMA5BQ9P283 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SEMA5BQ9P283 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SEMA5BQ9P283 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SEMA5BQ9P283 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SEMA5BQ9P283 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SEMA5BQ9P283 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SEMA5BQ9P283 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SEMA5BQ9P283 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SEMA5BQ9P283 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SEMA5BQ9P283 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SEMA5BQ9P283 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SEMA5BQ9P283 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SEMA5BQ9P283 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SEMA5BQ9P283 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SEMA5BQ9P283 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SEMA5BQ9P283 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SEMA5BQ9P283 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SEMA5BQ9P283 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SEMA5BQ9P283 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SEMA5BQ9P283 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SEMA5BQ9P283 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEMA5BQ9P283 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SEMA5BQ9P283 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SEMA5BQ9P283 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SEMA5BQ9P283 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SEMA5BQ9P283 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEMA5BQ9P283 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SEMA5BQ9P283 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SEMA5BQ9P283 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SEMA5BQ9P283 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEMA5BQ9P283 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEMA5BQ9P283 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEMA5BQ9P283 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEMA5BQ9P283 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SEMA5BQ9P283 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SEMA5BQ9P283 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SEMA5BQ9P283 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SEMA5BQ9P283 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEMA5BQ9P283 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SEMA5BQ9P283 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SEMA5BQ9P283 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEMA5BQ9P283 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SEMA5BQ9P283 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SEMA5BQ9P283 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SEMA5BQ9P283 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SEMA5BQ9P283 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SEMA5BQ9P283 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SEMA5BQ9P283 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEMA5BQ9P283 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SEMA5BQ9P283 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SEMA5BQ9P283 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SEMA5BQ9P283 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SEMA5BQ9P283 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEMA5BQ9P283 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEMA5BQ9P283 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEMA5BQ9P283 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEMA5BQ9P283 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEMA5BQ9P283 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEMA5BQ9P283 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEMA5BQ9P283 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEMA5BQ9P283 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEMA5BQ9P283 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEMA5BQ9P283 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEMA5BQ9P283 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEMA5BQ9P283 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEMA5BQ9P283 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEMA5BQ9P283 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEMA5BQ9P283 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SEMA5BQ9P283 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEMA5BQ9P283 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SEMA5BQ9P283 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEMA5BQ9P283 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SEMA5BQ9P283 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEMA5BQ9P283 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEMA5BQ9P283 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms