RNA–Protein interactions for RNA: YFR049W

YMR31, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene YMR31, Length 372 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR31	YFR049W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	RIT1	P23796	513 aa		3	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	KIN82	P25341	720 aa		3	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	IMP2'	P32351	346 aa		3	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	STE14	P32584	239 aa		3	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	RPP1	P38786	293 aa		3	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	VPS8	P39702	1274 aa		3	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	GID8	P40208	455 aa		3	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	ESL1	P40456	1118 aa		3	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	BIT61	P47041	543 aa		3	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	BNA1	P47096	177 aa		3	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	TAH11	P47112	604 aa		3	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	PEF1	P53238	335 aa		3	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	NRG1	Q03125	231 aa		3	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	SPC19	Q03954	165 aa		3	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	ARA2	Q04212	335 aa		3	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	TRI1	Q05024	226 aa		3	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	VID22	Q05934	901 aa		3	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	MCM21	Q06675	368 aa		3	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	AAD4	Q07747	329 aa		3	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	TRM8	Q12009	286 aa		3	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	HMG2	P12684	1045 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	BET2	P20133	325 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	ARG1	P22768	420 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	EMC1	P25574	760 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	CWH43	P25618	953 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	PRE4	P30657	266 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	CNS1	P33313	385 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	SET3	P36124	751 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	YBR138C	P38277	524 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	UBS1	P38290	277 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	SIC1	P38634	284 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	YLF2	P38746	405 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	SFB3	P38810	929 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	CAB2	P40506	365 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	PRM2	P40534	656 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	NCS6	P53088	359 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	SNO2	P53823	222 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	GAD1	Q04792	585 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	TRP3	P00937	484 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	SEC12	P11655	471 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	MRP7	P12687	371 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	PAH1	P32567	862 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	TFC3	P34111	1160 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	TOS1	P38288	455 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	YER010C	P40011	234 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	VFA1	P40080	203 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	LYS14	P40971	790 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	VTC2	P43585	828 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	SPO1	P53541	631 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	ATG21	Q02887	496 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	SNO4	Q04902	237 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	YCG1	Q06680	1035 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	RXT3	Q07458	294 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	CRD1	Q07560	283 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	HSP32	Q08992	237 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	AIM41	Q12032	185 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	HMI1	Q12039	706 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	TGL5	Q12043	749 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	COX17	Q12287	69 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	NPC2	Q12408	173 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	POM34	Q12445	299 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	CTT1	P06115	562 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	TPK1	P06244	397 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	MTC7	P32633	139 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	NFU1	P32860	256 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	EHT1	P38295	451 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	STB5	P38699	743 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	NPR3	P38742	1146 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	SKN7	P38889	622 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	2.97	□□□□□ -1.93	not detected
YMR31	YFR049W	MEF2	P39677	819 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	ECM1	P39715	212 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	FTR1	P40088	404 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	KHA1	P40309	873 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	FKH2	P41813	862 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	GSM1	P42950	618 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	CHA4	P43634	648 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	CTF18	P49956	741 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	YAP6	Q03935	383 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	TDA9	Q04545	1251 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YMR31	YFR049W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93

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