RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 AKR1B10O60218 316 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 LUZP1Q86V48 1076 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
PTPRJ-208ENST00000615445 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa23.58■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 GNA11P29992 359 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 CTAGE1Q96RT6 745 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 ATP7BP35670 1465 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 RRP9O43818 475 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 ATL3Q6DD88 541 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 KDRP35968 1356 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 SYNMO15061 1565 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 CEP135Q66GS9 1140 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 KRT79Q5XKE5 535 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
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PTPRJ-208ENST00000615445 USP6P35125 1406 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP23.55■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 NLRP1Q9C000 1473 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 STX17P56962 302 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 SPDYE3A6NKU9 549 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 SPATA5Q8NB90 893 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 ALS2CR12Q96Q35 445 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF532Q9HCE3 1301 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 NOP2P46087 812 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 DTHD1Q6ZMT9 781 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 SPAG5Q96R06 1193 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 PROSER3Q2NL68 480 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 MAP9Q49MG5 647 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP23.54■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 MROH5Q6ZUA9 1318 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 TMCO5BA8MYB1 307 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM160A1Q05DH4 1040 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 RILPL1Q5EBL4 403 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 IQUBQ8NA54 791 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.364e-7■■■■□ 20.5
PTPRJ-208ENST00000615445 GGA1Q9UJY5 639 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 DEXIO95424 95 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 JDP2Q8WYK2 163 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 MMRN2Q9H8L6 949 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 V9GY48 417 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 MYL10Q9BUA6 226 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.52■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF174Q15697 407 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 TM6SF1Q9BZW5 370 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRJ-208ENST00000615445 MACROD2A1Z1Q3 448 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 VWA3AA6NCI4 1184 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 WDR66Q8TBY9 1149 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 PLIN2Q99541 437 aa23.51■■□□□ 1.35
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PTPRJ-208ENST00000615445 A0A0D9SFI3 127 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 JADE2Q9NQC1 790 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 ERBB4Q15303 1308 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 CTDSPL2Q05D32 466 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 ANO1Q5XXA6 986 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
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PTPRJ-208ENST00000615445 CLCN1P35523 988 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 PRIMPOLQ96LW4 560 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 IFNKQ9P0W0 207 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 KIAA0754O94854 1291 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 DSCC1Q9BVC3 393 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 DNAI1Q9UI46 699 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 PTH1RQ03431 593 aa23.49■■□□□ 1.35
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PTPRJ-208ENST00000615445 MCM3P25205 808 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 RPS8P62241 208 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
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PTPRJ-208ENST00000615445 USP21Q9UK80 565 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.49■■□□□ 1.35
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PTPRJ-208ENST00000615445 PALD1Q9ULE6 856 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 ELP1O95163 1332 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
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PTPRJ-208ENST00000615445 PTGS1P23219 599 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 CHD1O14646 1710 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF853P0CG23 659 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 CBX1P83916 185 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 LRRC24Q50LG9 513 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 BICD1Q96G01 975 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
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