RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 PODXL2Q9NZ53 605 aa20.72■□□□□ 0.91
PACS1-208ENST00000529677 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
PACS1-208ENST00000529677 PDE8BO95263 885 aa20.71■□□□□ 0.91
PACS1-208ENST00000529677 TFCP2Q12800 502 aa20.71■□□□□ 0.91
PACS1-208ENST00000529677 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
PACS1-208ENST00000529677 METTL24Q5JXM2 366 aa20.71■□□□□ 0.91
PACS1-208ENST00000529677 CEP126Q9P2H0 1117 aa20.71■□□□□ 0.91
PACS1-208ENST00000529677 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
PACS1-208ENST00000529677 XDHP47989 1333 aa20.71■□□□□ 0.91
PACS1-208ENST00000529677 FGFR2P21802 821 aa20.7■□□□□ 0.9
PACS1-208ENST00000529677 CAP1Q01518 475 aa20.7■□□□□ 0.9
PACS1-208ENST00000529677 NUCB1Q02818 461 aa20.7■□□□□ 0.9
PACS1-208ENST00000529677 GMLQ99445 158 aa20.7■□□□□ 0.9
PACS1-208ENST00000529677 CEP290O15078 2479 aa20.7■□□□□ 0.9
PACS1-208ENST00000529677 EN2P19622 333 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
PACS1-208ENST00000529677 OTOP1Q7RTM1 612 aa20.69■□□□□ 0.9
PACS1-208ENST00000529677 TBC1D16Q8TBP0 767 aa20.69■□□□□ 0.9
PACS1-208ENST00000529677 C6orf229H3BNL8 230 aa20.68■□□□□ 0.9
PACS1-208ENST00000529677 LEMD3Q9Y2U8 911 aa20.68■□□□□ 0.9
PACS1-208ENST00000529677 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa20.68■□□□□ 0.9
PACS1-208ENST00000529677 COL6A3P12111 3177 aa20.67■□□□□ 0.9
PACS1-208ENST00000529677 UBE4AQ14139 1066 aa20.67■□□□□ 0.9
PACS1-208ENST00000529677 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
PACS1-208ENST00000529677 TNNI3KQ59H18 835 aa20.67■□□□□ 0.9
PACS1-208ENST00000529677 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
PACS1-208ENST00000529677 AKAP2Q9Y2D5 859 aa20.67■□□□□ 0.9
PACS1-208ENST00000529677 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa20.67■□□□□ 0.9
PACS1-208ENST00000529677 IRS2Q9Y4H2 1338 aa20.67■□□□□ 0.9
PACS1-208ENST00000529677 TAF5LO75529 589 aa20.66■□□□□ 0.9
PACS1-208ENST00000529677 ANKRD45Q5TZF3 282 aa20.66■□□□□ 0.9
PACS1-208ENST00000529677 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
PACS1-208ENST00000529677 CHD1LQ86WJ1 897 aa20.66■□□□□ 0.9
PACS1-208ENST00000529677 LPIN2Q92539 896 aa20.66■□□□□ 0.9
PACS1-208ENST00000529677 TRIM17Q9Y577 477 aa20.66■□□□□ 0.9
PACS1-208ENST00000529677 SALL3Q9BXA9 1300 aa20.65■□□□□ 0.9
PACS1-208ENST00000529677 APBB1O00213 710 aa20.65■□□□□ 0.9
PACS1-208ENST00000529677 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
PACS1-208ENST00000529677 ATP2B4P23634 1241 aa20.65■□□□□ 0.9
PACS1-208ENST00000529677 ATP2B3Q16720 1220 aa20.65■□□□□ 0.9
PACS1-208ENST00000529677 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
PACS1-208ENST00000529677 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
PACS1-208ENST00000529677 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
PACS1-208ENST00000529677 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa20.65■□□□□ 0.9
PACS1-208ENST00000529677 MYOZ2Q9NPC6 264 aa20.65■□□□□ 0.9
PACS1-208ENST00000529677 ZNF804BA4D1E1 1349 aa20.64■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 ARMC5Q96C12 935 aa20.64■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 OTUD5Q96G74 571 aa20.64■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa20.64■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 GGA1Q9UJY5 639 aa20.64■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 A0A0C4DFX4 3053 aa20.64■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 MED23Q9ULK4 1368 aa20.63■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 A0A1B0GUL7 405 aa20.63■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 NBPF9Q3BBW0 867 aa20.63■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 AGBL3Q8NEM8 1001 aa20.63■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 ZBTB22O15209 634 aa20.62■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 SLC5A1P13866 664 aa20.62■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 EYA3Q99504 573 aa20.62■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 PTPN22Q9Y2R2 807 aa20.62■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 SNAP23O00161 211 aa20.61■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 DLL1O00548 723 aa20.61■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 UFL1O94874 794 aa20.61■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 SREBF2Q12772 1141 aa20.61■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 AACSQ86V21 672 aa20.61■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 LNPKQ9C0E8 428 aa20.61■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP20.6■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 PDE4AP27815 886 aa20.6■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 TIMM10P62072 90 aa20.6■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 LDLRAD1Q5T700 205 aa20.6■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 SPRYD7Q5W111 196 aa20.6■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 FZD1Q9UP38 647 aa20.6■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 USP17L8P0C7I0 530 aa20.59■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 KCNJ4P48050 445 aa20.59■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 XAGE2Q96GT9 111 aa20.59■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 DBNDD2Q9BQY9 259 aa20.59■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 CUL9Q8IWT3 2517 aa20.59■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 SSC5DA1L4H1 1573 aa20.59■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 H0YGN5 161 aa20.58■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 KLRK1P26718 216 aa20.58■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 ADORA1P30542 326 aa20.58■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 CD99L2Q8TCZ2 262 aa20.58■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 MXD3Q9BW11 206 aa20.58■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 STAP2Q9UGK3 403 aa20.58■□□□□ 0.89
PACS1-208ENST00000529677 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 FBXO33Q7Z6M2 555 aa20.57■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 IFNL1Q8IU54 200 aa20.57■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 NEUROD6Q96NK8 337 aa20.57■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 AOX1Q06278 1338 aa20.56■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 TTC41PQ6P2S7 1318 aa20.56■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 WNT10BO00744 389 aa20.56■□□□□ 0.88
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