RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522878.5

ARFGEF1-208, Transcript of ADP ribosylation factor guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene ARFGEF1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1-208ENST00000522878 RFX1P22670 979 aa7.37□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 PROX2Q3B8N5 592 aa7.37□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 NBPF6Q5VWK0 638 aa7.37□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 USHBP1Q8N6Y0 703 aa7.37□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 MASTLQ96GX5 879 aa7.37□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 NBPF4Q96M43 638 aa7.37□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 FBXL18Q96ME1 805 aa7.37□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 PSMD1Q99460 953 aa7.37□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 LRRC37A2A6NM11 1700 aa7.37□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 DOCK3Q8IZD9 2030 aa7.37□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 ZPR1O75312 459 aa7.36□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 EPAS1Q99814 870 aa7.36□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 THEGQ9P2T0 379 aa7.36□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 NARFQ9UHQ1 456 aa7.36□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 MGAMO43451 1857 aa7.36□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa7.35□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa7.35□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 GJB1P08034 283 aa7.35□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 SREBF2Q12772 1141 aa7.35□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 RIC3Q7Z5B4 369 aa7.35□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa7.35□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 RABGEF1Q9UJ41 708 aa7.35□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa7.35□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa7.35□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 KIF24Q5T7B8 1368 aa7.34□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 TONSLQ96HA7 1378 aa7.34□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 FRYQ5TBA9 3013 aa7.34□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 SOWAHBA6NEL2 793 aa7.34□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 ALDH1A1P00352 501 aa7.34□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 EGFRP00533 1210 aa7.34□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 KCNC4Q03721 635 aa7.34□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 CXCL9Q07325 125 aa7.34□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 LAPTM4AQ15012 233 aa7.34□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa7.34□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 MOB2Q70IA6 237 aa7.34□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 NKX2-3Q8TAU0 364 aa7.34□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 NLRP7Q8WX94 980 aa7.34□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 LIMD1Q9UGP4 676 aa7.34□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 ZZEF1O43149 2961 aa7.34□□□□□ -1.23
ARFGEF1-208ENST00000522878 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 SPEGQ15772 3267 aa7.33□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 BMP1P13497 986 aa7.33□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 SYN1P17600 705 aa7.33□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 TATP17735 454 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 TRAF7Q6Q0C0 670 aa7.33□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 C7orf61Q8IZ16 206 aa7.33□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 CDCA5Q96FF9 252 aa7.33□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 COL15A1P39059 1388 aa7.33□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 FRYLO94915 3013 aa7.32□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 SCN9AQ15858 1988 aa7.32□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 GFRA3O60609 400 aa7.32□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 AP1G2O75843 785 aa7.32□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 HOXC9P31274 260 aa7.32□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 FKBP1BP68106 108 aa7.32□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 SP3Q02447 781 aa7.32□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 CRHR2Q13324 411 aa7.32□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 NYAP1Q6ZVC0 841 aa7.32□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa7.32□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa7.32□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 KCNH6Q9H252 994 aa7.32□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 ZNF462Q96JM2 2506 aa7.32□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 PTPN13Q12923 2485 aa7.32□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 PRR33A8MZF0 331 aa7.31□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 TUSC1Q2TAM9 212 aa7.31□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 NME9Q86XW9 330 aa7.31□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 LARGE2Q8N3Y3 721 aa7.31□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 PXYLP1Q8TE99 480 aa7.31□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 MAST2Q6P0Q8 1798 aa7.31□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 NCAPD2Q15021 1401 aa7.3□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 UBE2Q2LH0YL09 131 aa7.3□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa7.3□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 WASHC4Q2M389 1173 aa7.3□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 TBC1D9BQ66K14 1250 aa7.3□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 VRTNQ9H8Y1 702 aa7.3□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa7.3□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 PSME4Q14997 1843 aa7.29□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 MYO18BQ8IUG5 2567 aa7.29□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 RIC1Q4ADV7 1423 aa7.29□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 SPTLC1O15269 473 aa7.29□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 CCL5P13501 91 aa7.29□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 SLC51AQ86UW1 340 aa7.29□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 LAPTM4BQ86VI4 370 aa7.29□□□□□ -1.24
ARFGEF1-208ENST00000522878 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms