RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521993.2

ERLIN2-209, Transcript of ER lipid raft associated 2, human

TSL 3

Gene ERLIN2, Length 764 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERLIN2-209	ENST00000521993	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		12.51	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	AOX1	Q06278	1338 aa		12.51	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		12.51	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	VGLL4	Q14135	290 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	CCDC27	Q2M243	656 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	G2E3	Q7L622	706 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	TEPSIN	Q96N21	525 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	JAG2	Q9Y219	1238 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	SPEF2	Q9C093	1822 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	HTT	P42858	3142 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	FLII	Q13045	1269 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	ERO1B	Q86YB8	467 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	WDR63	Q8IWG1	891 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	12.49	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	DPF3	Q92784	378 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	PLIN1	O60240	522 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	FOXO4	P98177	505 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	SNAPC2	Q13487	334 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	HOOK2	Q96ED9	719 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	HOXD10	P28358	340 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	CRK	P46108	304 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	BTBD19	C9JJ37	291 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	UBE4A	Q14139	1066 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ERLIN2-209	ENST00000521993	IRF6	O14896	467 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ERLIN2-209	ENST00000521993	GJB1	P08034	283 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ERLIN2-209	ENST00000521993	GYG1	P46976	350 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ERLIN2-209	ENST00000521993	PPIL2	Q13356	520 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ERLIN2-209	ENST00000521993	C17orf99	Q6UX52	265 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ERLIN2-209	ENST00000521993	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
ERLIN2-209	ENST00000521993	WRNIP1	Q96S55	665 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ERLIN2-209	ENST00000521993	SRRD	Q9UH36	339 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ERLIN2-209	ENST00000521993	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ERLIN2-209	ENST00000521993	DLL1	O00548	723 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ERLIN2-209	ENST00000521993	GRK4	P32298	578 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ERLIN2-209	ENST00000521993	PSMC4	P43686	418 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ERLIN2-209	ENST00000521993	GJA8	P48165	433 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ERLIN2-209	ENST00000521993	PPAT	Q06203	517 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ERLIN2-209	ENST00000521993	SLFN5	Q08AF3	891 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ERLIN2-209	ENST00000521993	MTFR1	Q15390	333 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ERLIN2-209	ENST00000521993	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ERLIN2-209	ENST00000521993	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ERLIN2-209	ENST00000521993	RAET1E	Q8TD07	263 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ERLIN2-209	ENST00000521993	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ERLIN2-209	ENST00000521993	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
ERLIN2-209	ENST00000521993	SHISA4	Q96DD7	197 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ERLIN2-209	ENST00000521993	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
ERLIN2-209	ENST00000521993	TRIM47	Q96LD4	638 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ERLIN2-209	ENST00000521993	MRI	Q9BWK5	157 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ERLIN2-209	ENST00000521993	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ERLIN2-209	ENST00000521993	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ERLIN2-209	ENST00000521993	ZNF521	Q96K83	1311 aa		12.43	□□□□□ -0.42
ERLIN2-209	ENST00000521993	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
ERLIN2-209	ENST00000521993	UBXN2A	P68543	259 aa		12.43	□□□□□ -0.42
ERLIN2-209	ENST00000521993	BEND3	Q5T5X7	828 aa		12.43	□□□□□ -0.42
ERLIN2-209	ENST00000521993	DCAF15	Q66K64	600 aa		12.43	□□□□□ -0.42
ERLIN2-209	ENST00000521993	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		12.43	□□□□□ -0.42
ERLIN2-209	ENST00000521993	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		12.43	□□□□□ -0.42
ERLIN2-209	ENST00000521993	FAM83A	Q86UY5	434 aa		12.43	□□□□□ -0.42
ERLIN2-209	ENST00000521993	VPS37D	Q86XT2	251 aa		12.43	□□□□□ -0.42
ERLIN2-209	ENST00000521993	TEKT1	Q969V4	418 aa		12.43	□□□□□ -0.42
ERLIN2-209	ENST00000521993	CPA4	Q9UI42	421 aa		12.43	□□□□□ -0.42
ERLIN2-209	ENST00000521993	IL16	Q14005	1332 aa		12.42	□□□□□ -0.42
ERLIN2-209	ENST00000521993	OTOF	Q9HC10	1997 aa		12.42	□□□□□ -0.42
ERLIN2-209	ENST00000521993		A0A1W2PPC1	479 aa		12.42	□□□□□ -0.42

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms