RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508769.1

SIMC1-210, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene SIMC1, Length 461 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-210ENST00000508769 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
SIMC1-210ENST00000508769 MAP3K11Q16584 847 aa29.07■■■□□ 2.24
SIMC1-210ENST00000508769 SPRYD7Q5W111 196 aa29.07■■■□□ 2.24
SIMC1-210ENST00000508769 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
SIMC1-210ENST00000508769 TM4SF4P48230 202 aa29.06■■■□□ 2.24
SIMC1-210ENST00000508769 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
SIMC1-210ENST00000508769 TCP10L2B9ZVM9 353 aa29.05■■■□□ 2.24
SIMC1-210ENST00000508769 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
SIMC1-210ENST00000508769 CACNB3P54284 484 aa29.05■■■□□ 2.24
SIMC1-210ENST00000508769 TEPSINQ96N21 525 aa29.05■■■□□ 2.24
SIMC1-210ENST00000508769 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa29.05■■■□□ 2.24
SIMC1-210ENST00000508769 USP2O75604 605 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
SIMC1-210ENST00000508769 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
SIMC1-210ENST00000508769 KIF16BQ96L93 1317 aa29.03■■■□□ 2.24
SIMC1-210ENST00000508769 GJA5P36382 358 aa29.03■■■□□ 2.24
SIMC1-210ENST00000508769 TMEM39BQ9GZU3 492 aa29.03■■■□□ 2.24
SIMC1-210ENST00000508769 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
SIMC1-210ENST00000508769 SLC5A1P13866 664 aa29.02■■■□□ 2.24
SIMC1-210ENST00000508769 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa29.02■■■□□ 2.24
SIMC1-210ENST00000508769 SLC10A4Q96EP9 437 aa29.02■■■□□ 2.24
SIMC1-210ENST00000508769 WNK4Q96J92 1243 aa29.02■■■□□ 2.24
SIMC1-210ENST00000508769 BCAR3O75815 825 aa29.01■■■□□ 2.23
SIMC1-210ENST00000508769 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa29.01■■■□□ 2.23
SIMC1-210ENST00000508769 LPIN2Q92539 896 aa29.01■■■□□ 2.23
SIMC1-210ENST00000508769 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
SIMC1-210ENST00000508769 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
SIMC1-210ENST00000508769 CIAO1O76071 339 aa28.99■■■□□ 2.23
SIMC1-210ENST00000508769 ATP2B3Q16720 1220 aa28.99■■■□□ 2.23
SIMC1-210ENST00000508769 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
SIMC1-210ENST00000508769 SREBF2Q12772 1141 aa28.98■■■□□ 2.23
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SIMC1-210ENST00000508769 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
SIMC1-210ENST00000508769 TEKT1Q969V4 418 aa28.98■■■□□ 2.23
SIMC1-210ENST00000508769 TRIM27P14373 513 aa28.97■■■□□ 2.23
SIMC1-210ENST00000508769 ADORA1P30542 326 aa28.97■■■□□ 2.23
SIMC1-210ENST00000508769 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
SIMC1-210ENST00000508769 ARHGAP45Q92619 1136 aa28.97■■■□□ 2.23
SIMC1-210ENST00000508769 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
SIMC1-210ENST00000508769 ZDHHC15Q96MV8 337 aa28.97■■■□□ 2.23
SIMC1-210ENST00000508769 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP28.96■■■□□ 2.23
SIMC1-210ENST00000508769 PHKA1P46020 1223 aa28.96■■■□□ 2.23
SIMC1-210ENST00000508769 IREB2P48200 963 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
SIMC1-210ENST00000508769 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
SIMC1-210ENST00000508769 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa28.96■■■□□ 2.23
SIMC1-210ENST00000508769 CEP126Q9P2H0 1117 aa28.96■■■□□ 2.23
SIMC1-210ENST00000508769 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
SIMC1-210ENST00000508769 GPR25O00155 361 aa28.95■■■□□ 2.22
SIMC1-210ENST00000508769 ELP3Q9H9T3 547 aa28.95■■■□□ 2.22
SIMC1-210ENST00000508769 COPRSQ9NQ92 184 aa28.95■■■□□ 2.22
SIMC1-210ENST00000508769 FBXO3Q9UK99 471 aa28.95■■■□□ 2.22
SIMC1-210ENST00000508769 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
SIMC1-210ENST00000508769 PRDX5P30044 214 aa28.94■■■□□ 2.22
SIMC1-210ENST00000508769 DIXDC1Q155Q3 683 aa28.94■■■□□ 2.22
SIMC1-210ENST00000508769 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
SIMC1-210ENST00000508769 IFNL1Q8IU54 200 aa28.94■■■□□ 2.22
SIMC1-210ENST00000508769 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa28.94■■■□□ 2.22
SIMC1-210ENST00000508769 CLUAP1Q96AJ1 413 aa28.94■■■□□ 2.22
SIMC1-210ENST00000508769 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
SIMC1-210ENST00000508769 IL15P40933 162 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
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SIMC1-210ENST00000508769 TNNI2P48788 182 aa28.91■■■□□ 2.22
SIMC1-210ENST00000508769 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa28.91■■■□□ 2.22
SIMC1-210ENST00000508769 WDR66Q8TBY9 1149 aa28.91■■■□□ 2.22
SIMC1-210ENST00000508769 OPTNQ96CV9 577 aa28.91■■■□□ 2.22
SIMC1-210ENST00000508769 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
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SIMC1-210ENST00000508769 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa28.91■■■□□ 2.22
SIMC1-210ENST00000508769 MAST3O60307 1309 aa28.91■■■□□ 2.22
SIMC1-210ENST00000508769 SRGAP3O43295 1099 aa28.9■■■□□ 2.22
SIMC1-210ENST00000508769 RGS19P49795 217 aa28.9■■■□□ 2.22
SIMC1-210ENST00000508769 VGLL4Q14135 290 aa28.9■■■□□ 2.22
SIMC1-210ENST00000508769 HHIPL2Q6UWX4 724 aa28.9■■■□□ 2.22
SIMC1-210ENST00000508769 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP28.9■■■□□ 2.22
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SIMC1-210ENST00000508769 GNAI3P08754 354 aa28.89■■■□□ 2.22
SIMC1-210ENST00000508769 TIMM10P62072 90 aa28.89■■■□□ 2.22
SIMC1-210ENST00000508769 SOX10P56693 466 aa28.88■■■□□ 2.21
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SIMC1-210ENST00000508769 CCDC102BQ68D86 513 aa28.88■■■□□ 2.21
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SIMC1-210ENST00000508769 HDAC5Q9UQL6 1122 aa28.87■■■□□ 2.21
SIMC1-210ENST00000508769 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa28.86■■■□□ 2.21
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SIMC1-210ENST00000508769 MAP3K9P80192 1104 aa28.86■■■□□ 2.21
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SIMC1-210ENST00000508769 RASGRF1Q13972 1273 aa28.86■■■□□ 2.21
SIMC1-210ENST00000508769 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa28.86■■■□□ 2.21
SIMC1-210ENST00000508769 FAM83AQ86UY5 434 aa28.86■■■□□ 2.21
SIMC1-210ENST00000508769 TMEM57Q8N5G2 664 aa28.86■■■□□ 2.21
SIMC1-210ENST00000508769 MS4A4AQ96JQ5 239 aa28.86■■■□□ 2.21
SIMC1-210ENST00000508769 TMOD2Q9NZR1 351 aa28.86■■■□□ 2.21
SIMC1-210ENST00000508769 INHBEP58166 350 aa28.85■■■□□ 2.21
SIMC1-210ENST00000508769 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa28.85■■■□□ 2.21
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