RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 MRS2Q9HD23 443 aa3.3□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 KIAA1468Q9P260 1216 aa3.3□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa3.3□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 CD2APQ9Y5K6 639 aa3.3□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 COMMD10Q9Y6G5 202 aa3.3□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 DNAH7Q8WXX0 4024 aa3.3□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 NUDT7P0C024 238 aa3.3□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 ORC1Q13415 861 aa3.3□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 BIRC2Q13490 618 aa3.3□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 FZD9O00144 591 aa3.29□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 LGR5O75473 907 aa3.29□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 ARMC2Q8NEN0 867 aa3.29□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 OSBPL3Q9H4L5 887 aa3.29□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 MAPK8P45983 427 aa3.29□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 POU5F1BQ06416 359 aa3.29□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 DDR2Q16832 855 aa3.29□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 ATCAYQ86WG3 371 aa3.29□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 HOMER1Q86YM7 354 aa3.29□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 HOMER2Q9NSB8 354 aa3.29□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 CSMD1Q96PZ7 3565 aa3.29□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC189A1A4V9 331 aa3.29□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 UPK3BL1B0FP48 263 aa3.29□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 UPK3BL2E5RIL1 263 aa3.29□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 BPNT1O95861 308 aa3.29□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 SCTRP47872 440 aa3.29□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 LRRC41Q15345 812 aa3.29□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC184Q52MB2 194 aa3.29□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 KANK3Q6NY19 840 aa3.29□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 AMOTL1Q8IY63 956 aa3.29□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa3.29□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 PRDM10Q9NQV6 1147 aa3.29□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 SWAP70Q9UH65 585 aa3.29□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 RABGEF1Q9UJ41 708 aa3.29□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 SCINQ9Y6U3 715 aa3.29□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 DNAH6Q9C0G6 4158 aa3.29□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 ARSIQ5FYB1 569 aa3.28□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa3.28□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 XIRP2A4UGR9 3374 aa3.28□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 K7ESF4 209 aa3.28□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 INHAP05111 366 aa3.28□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 PTPREP23469 700 aa3.28□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 PI16Q6UXB8 463 aa3.28□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 NKX2-3Q8TAU0 364 aa3.28□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC136Q96JN2 1154 aa3.28□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 CEP63Q96MT8 703 aa3.28□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 CHRDQ9H2X0 955 aa3.28□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 TCF7L1Q9HCS4 588 aa3.28□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 FAM8A1Q9UBU6 413 aa3.28□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa3.28□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 PIK3C2AO00443 1686 aa3.28□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 LY75O60449 1722 aa3.28□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa3.28□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 GSG1L2A8MUP6 293 aa3.28□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 RNF40O75150 1001 aa3.28□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 POTEJP0CG39 1038 aa3.28□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 USP4Q13107 963 aa3.28□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 FBXL19Q6PCT2 694 aa3.28□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 LAPTM4BQ86VI4 370 aa3.28□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 VPS37DQ86XT2 251 aa3.28□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 IFNL3Q8IZI9 196 aa3.28□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 CDH19Q9H159 772 aa3.28□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 KBTBD4Q9NVX7 518 aa3.28□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 CFAP54Q96N23 3096 aa3.28□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 PHF20L1A8MW92 1017 aa3.28□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 ADCY3O60266 1144 aa3.28□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 ALDH1L1O75891 902 aa3.28□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 CCNYL3P0C7X3 344 aa3.28□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 GRNP28799 593 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 TTC8Q8TAM2 541 aa3.28□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 NINJ1Q92982 152 aa3.28□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 ARPC5LQ9BPX5 153 aa3.28□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa3.28□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 OSGEPQ9NPF4 335 aa3.28□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 USP3Q9Y6I4 520 aa3.28□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 MON2Q7Z3U7 1717 aa3.27□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 CAND2O75155 1236 aa3.27□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 LDHAP00338 332 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 IGF2-ASQ6U949 168 aa3.27□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 NLRP8Q86W28 1048 aa3.27□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 SPICE1Q8N0Z3 855 aa3.27□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms