RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000030117.4

Smu1-201, Transcript of WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Smu1, Length 2,418 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1-201ENSMUST00000030117 Dctpp1Q9QY93 170 aa20.63■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ccne2Q9Z238 404 aa20.63■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Hap1O35668 628 aa20.63■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Irx2P81066 474 aa20.63■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Prdm1Q60636 856 aa20.63■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ercc6lQ8BHK9 1240 aa20.63■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ints5Q8CHT3 1018 aa20.63■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Tubb4aQ9D6F9 444 aa20.63■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Vnn1Q9Z0K8 512 aa20.63■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Dnajc25A2ALW5 357 aa20.62■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Metap2O08663 478 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cyp26a1O55127 497 aa20.62■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Epha2Q03145 977 aa20.62■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ccdc102aQ3TMW1 549 aa20.62■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 AbraQ8BUZ1 375 aa20.62■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Spata32Q8C5V0 334 aa20.62■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Lrrc2Q8VDB8 371 aa20.62■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Mtmr6Q8VE11 617 aa20.62■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 CpdO89001 1377 aa20.62■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Fez2Q6TYB5 348 aa20.62■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Vps18Q8R307 973 aa20.62■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Abcb6Q9DC29 842 aa20.62■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Atp12aQ9Z1W8 1035 aa20.62■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Abca15E9PWH4 1668 aa20.61■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Znf326O88291 580 aa20.61■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Prpf4bQ61136 1007 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Nek3Q9R0A5 511 aa20.61■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Sycp2lA0A0M3U1B0 842 aa20.61■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Dnm1P39053 867 aa20.61■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 ErmnQ5EBJ4 281 aa20.61■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Nol10Q5RJG1 687 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Mns1Q61884 491 aa20.61■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Edrf1Q6GQV7 1239 aa20.61■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Trak2Q6P9N8 913 aa20.61■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 IqcgQ80W32 419 aa20.61■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Stac3Q8BZ71 360 aa20.61■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 DymQ8CHY3 669 aa20.61■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Pcdhb22Q91XZ8 794 aa20.61■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Sil1Q9EPK6 465 aa20.61■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Col3a1P08121 1464 aa20.6■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Lipo1J3QME6 396 aa20.6■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Llgl2Q3TJ91 1027 aa20.6■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cep120Q7TSG1 988 aa20.6■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Pnpla2Q8BJ56 486 aa20.6■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 ChmQ9QXG2 665 aa20.6■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Zfp597E9Q6S0 419 aa20.59■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Dapk3O54784 448 aa20.59■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Me1P06801 572 aa20.59■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ftl2P49945 183 aa20.59■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 BcanQ61361 883 aa20.59■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Zkscan8Q8BSL0 588 aa20.59■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cyp2d9P11714 504 aa20.59■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Uri1Q3TLD5 531 aa20.59■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Kmt5bQ3U8K7 883 aa20.59■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 PsdQ5DTT2 1024 aa20.59■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Fam160b2Q80YR2 744 aa20.59■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Vps37dQ810I0 261 aa20.59■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 CebpaP53566 359 aa20.58■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cdkl5Q3UTQ8 938 aa20.58■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Acap3Q6NXL5 833 aa20.58■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Arl8aQ8VEH3 186 aa20.58■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Fam76aQ922G2 307 aa20.58■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Tgs1Q923W1 853 aa20.58■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Gnl2Q99LH1 728 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Gtpbp4Q99ME9 634 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Tbc1d7Q9D0K0 293 aa20.58■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Zbtb43Q9DAI4 467 aa20.58■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Kdm3aQ6PCM1 1323 aa20.58■□□□□ 0.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Gm21680A0A0G2JGR8 267 aa20.58■□□□□ 0.88
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cyp3a59D3Z2W7 503 aa20.58■□□□□ 0.88
Smu1-201ENSMUST00000030117 Diaph1O08808 1255 aa20.58■□□□□ 0.88
Smu1-201ENSMUST00000030117 Anxa1P10107 346 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
Smu1-201ENSMUST00000030117 Bola3Q8CEI1 110 aa20.58■□□□□ 0.88
Smu1-201ENSMUST00000030117 Emilin1Q99K41 1017 aa20.58■□□□□ 0.88
Smu1-201ENSMUST00000030117 Mrps25Q9D125 171 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
Smu1-201ENSMUST00000030117 Alx1Q8C8B0 326 aa20.57■□□□□ 0.88
Smu1-201ENSMUST00000030117 Tiam2Q6ZPF3 1715 aa20.57■□□□□ 0.88
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cplx2P84086 134 aa20.56■□□□□ 0.88
Smu1-201ENSMUST00000030117 Arhgef16Q3U5C8 713 aa20.56■□□□□ 0.88
Smu1-201ENSMUST00000030117 Prl2c1Q5SVL9 228 aa20.56■□□□□ 0.88
Smu1-201ENSMUST00000030117 RbsnQ80Y56 783 aa20.56■□□□□ 0.88
Smu1-201ENSMUST00000030117 Haus7Q8BKT8 364 aa20.56■□□□□ 0.88
Smu1-201ENSMUST00000030117 Pde4bB1AWC9 736 aa20.56■□□□□ 0.88
Smu1-201ENSMUST00000030117 Plekhd1B2RPU2 505 aa20.56■□□□□ 0.88
Smu1-201ENSMUST00000030117 Zbtb21E9Q444 1094 aa20.56■□□□□ 0.88
Smu1-201ENSMUST00000030117 Pcdhb9E9Q5G2 828 aa20.56■□□□□ 0.88
Smu1-201ENSMUST00000030117 Pde6aP27664 859 aa20.56■□□□□ 0.88
Smu1-201ENSMUST00000030117 Kcnj4P52189 445 aa20.56■□□□□ 0.88
Smu1-201ENSMUST00000030117 MpndQ3TV65 487 aa20.56■□□□□ 0.88
Smu1-201ENSMUST00000030117 Adam1aQ60813 791 aa20.56■□□□□ 0.88
Smu1-201ENSMUST00000030117 Brd3Q8K2F0 726 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
Smu1-201ENSMUST00000030117 Kcnh3Q9WVJ0 1095 aa20.56■□□□□ 0.88
Smu1-201ENSMUST00000030117 Myo3bQ1EG27 1305 aa20.56■□□□□ 0.88
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cdc27A2A6Q5 825 aa20.55■□□□□ 0.88
Smu1-201ENSMUST00000030117 Atp8b5A3FIN4 1183 aa20.55■□□□□ 0.88
Smu1-201ENSMUST00000030117 Actn3O88990 900 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
Smu1-201ENSMUST00000030117 Gpr182P43142 395 aa20.55■□□□□ 0.88
Smu1-201ENSMUST00000030117 Atp8a2P98200 1148 aa20.55■□□□□ 0.88
Smu1-201ENSMUST00000030117 Clca2Q8BG22 942 aa20.55■□□□□ 0.88
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ranbp6Q8BIV3 1105 aa20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 103.8 ms