Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Tubb4aQ9D6F9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Tubb4aQ9D6F9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Tubb4aQ9D6F9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Tubb4aQ9D6F9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Tubb4aQ9D6F9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
Tubb4aQ9D6F9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Tubb4aQ9D6F9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Tubb4aQ9D6F9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Tubb4aQ9D6F9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Tubb4aQ9D6F9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Tubb4aQ9D6F9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Tubb4aQ9D6F9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Tubb4aQ9D6F9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Tubb4aQ9D6F9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Tubb4aQ9D6F9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Tubb4aQ9D6F9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Tubb4aQ9D6F9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Tubb4aQ9D6F9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Tubb4aQ9D6F9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Tubb4aQ9D6F9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Tubb4aQ9D6F9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Tubb4aQ9D6F9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Tubb4aQ9D6F9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Tubb4aQ9D6F9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Tubb4aQ9D6F9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Tubb4aQ9D6F9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Tubb4aQ9D6F9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Tubb4aQ9D6F9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Tubb4aQ9D6F9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Tubb4aQ9D6F9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Tubb4aQ9D6F9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Tubb4aQ9D6F9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Tubb4aQ9D6F9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Tubb4aQ9D6F9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Tubb4aQ9D6F9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Tubb4aQ9D6F9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Tubb4aQ9D6F9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Tubb4aQ9D6F9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Tubb4aQ9D6F9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Tubb4aQ9D6F9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Tubb4aQ9D6F9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Tubb4aQ9D6F9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Tubb4aQ9D6F9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Tubb4aQ9D6F9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Tubb4aQ9D6F9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Tubb4aQ9D6F9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Tubb4aQ9D6F9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Tubb4aQ9D6F9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Tubb4aQ9D6F9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Tubb4aQ9D6F9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Tubb4aQ9D6F9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Tubb4aQ9D6F9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Tubb4aQ9D6F9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Tubb4aQ9D6F9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Tubb4aQ9D6F9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Tubb4aQ9D6F9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Tubb4aQ9D6F9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Tubb4aQ9D6F9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Tubb4aQ9D6F9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Tubb4aQ9D6F9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Tubb4aQ9D6F9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Tubb4aQ9D6F9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Tubb4aQ9D6F9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Tubb4aQ9D6F9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Tubb4aQ9D6F9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Tubb4aQ9D6F9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Tubb4aQ9D6F9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Tubb4aQ9D6F9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Tubb4aQ9D6F9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Tubb4aQ9D6F9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Tubb4aQ9D6F9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Tubb4aQ9D6F9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Tubb4aQ9D6F9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tubb4aQ9D6F9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tubb4aQ9D6F9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Tubb4aQ9D6F9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Tubb4aQ9D6F9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Tubb4aQ9D6F9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Tubb4aQ9D6F9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Tubb4aQ9D6F9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tubb4aQ9D6F9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tubb4aQ9D6F9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tubb4aQ9D6F9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tubb4aQ9D6F9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tubb4aQ9D6F9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tubb4aQ9D6F9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tubb4aQ9D6F9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tubb4aQ9D6F9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tubb4aQ9D6F9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tubb4aQ9D6F9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tubb4aQ9D6F9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tubb4aQ9D6F9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tubb4aQ9D6F9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tubb4aQ9D6F9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tubb4aQ9D6F9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tubb4aQ9D6F9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tubb4aQ9D6F9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tubb4aQ9D6F9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms