Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI1

Bola3, BolA-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bola3Q8CEI1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43.13■■■■■ 4.49
Bola3Q8CEI1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Bola3Q8CEI1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Bola3Q8CEI1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Bola3Q8CEI1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Bola3Q8CEI1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Bola3Q8CEI1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
Bola3Q8CEI1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
Bola3Q8CEI1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
Bola3Q8CEI1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Bola3Q8CEI1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
Bola3Q8CEI1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Bola3Q8CEI1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
Bola3Q8CEI1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Bola3Q8CEI1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Bola3Q8CEI1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Bola3Q8CEI1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
Bola3Q8CEI1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Bola3Q8CEI1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Bola3Q8CEI1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Bola3Q8CEI1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Bola3Q8CEI1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Bola3Q8CEI1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Bola3Q8CEI1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Bola3Q8CEI1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Bola3Q8CEI1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
Bola3Q8CEI1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Bola3Q8CEI1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Bola3Q8CEI1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Bola3Q8CEI1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Bola3Q8CEI1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Bola3Q8CEI1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Bola3Q8CEI1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Bola3Q8CEI1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Bola3Q8CEI1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Bola3Q8CEI1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Bola3Q8CEI1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Bola3Q8CEI1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Bola3Q8CEI1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Bola3Q8CEI1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Bola3Q8CEI1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Bola3Q8CEI1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Bola3Q8CEI1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Bola3Q8CEI1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Bola3Q8CEI1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Bola3Q8CEI1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Bola3Q8CEI1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Bola3Q8CEI1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Bola3Q8CEI1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Bola3Q8CEI1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Bola3Q8CEI1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Bola3Q8CEI1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Bola3Q8CEI1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Bola3Q8CEI1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Bola3Q8CEI1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Bola3Q8CEI1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Bola3Q8CEI1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Bola3Q8CEI1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Bola3Q8CEI1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Bola3Q8CEI1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Bola3Q8CEI1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Bola3Q8CEI1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Bola3Q8CEI1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Bola3Q8CEI1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Bola3Q8CEI1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Bola3Q8CEI1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Bola3Q8CEI1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Bola3Q8CEI1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Bola3Q8CEI1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Bola3Q8CEI1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Bola3Q8CEI1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.32■■■□□ 2.93
Bola3Q8CEI1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Bola3Q8CEI1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Bola3Q8CEI1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Bola3Q8CEI1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Bola3Q8CEI1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Bola3Q8CEI1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Bola3Q8CEI1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Bola3Q8CEI1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Bola3Q8CEI1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Bola3Q8CEI1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Bola3Q8CEI1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Bola3Q8CEI1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Bola3Q8CEI1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Bola3Q8CEI1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Bola3Q8CEI1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Bola3Q8CEI1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Bola3Q8CEI1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Bola3Q8CEI1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Bola3Q8CEI1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Bola3Q8CEI1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Bola3Q8CEI1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Bola3Q8CEI1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Bola3Q8CEI1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Bola3Q8CEI1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Bola3Q8CEI1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Bola3Q8CEI1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Bola3Q8CEI1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Bola3Q8CEI1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Bola3Q8CEI1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms