RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF66Q6ZN08 573 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF788Q6ZQV5 615 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 FGFRL1Q8N441 504 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 GAFA1Q96PS6 74 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 YPEL2Q96QA6 119 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 RAB40CQ96S21 281 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 FAM234AQ9H0X4 552 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF665Q9H7R5 613 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 COA4Q9NYJ1 87 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 NUP50Q9UKX7 468 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 MMP24Q9Y5R2 645 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 ROS1P08922 2347 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 VSTM5A8MXK1 200 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 DEFB108AA8MXU0 73 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 SHISA9B4DS77 424 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 ST8SIA5O15466 376 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 RAMP3O60896 148 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 NXPH3O95157 252 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 CLDN1O95832 211 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 P0C879 139 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 SELLP14151 372 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 IRF2P14316 349 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 BRWD1-AS2P59051 145 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 BLOC1S1P78537 153 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 CCL8P80075 99 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF266Q14584 549 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 C4orf17Q53FE4 359 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 FAM209AQ5JX71 171 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 PXDC1Q5TGL8 231 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 IL34Q6ZMJ4 242 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 STPG2Q8N412 459 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 NARFLQ9H6Q4 476 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 RAB9BQ9NP90 201 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 PARP11Q9NR21 331 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 MMP26Q9NRE1 261 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 CALYQ9NYX4 217 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 PSG11Q9UQ72 335 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 WSB1Q9Y6I7 421 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 FAM90A26D6RGX4 464 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 ITGB1BP1O14713 200 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 SYNGR2O43760 224 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 MED6O75586 246 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 CRYZL1O95825 349 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 C17orf58Q2M2W7 97 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 BTNL3Q6UXE8 466 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 SPAG16Q8N0X2 631 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 GNG12Q9UBI6 72 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa6.79□□□□□ -1.32
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PDE4D-208ENST00000502484 CENPEQ02224 2701 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 LRRC30A6NM36 301 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 LINC00473A8K010 186 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 C17orf98A8MV24 154 aa6.79□□□□□ -1.32
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PDE4D-208ENST00000502484 SIGLEC5O15389 551 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 TXNL1O43396 289 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 ATG12O94817 140 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
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PDE4D-208ENST00000502484 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 Q3ZCU0 254 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 OR5C1Q8NGR4 320 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 DCAF16Q9NXF7 216 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 LAMP3Q9UQV4 416 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 PKDREJQ9NTG1 2253 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 E7EQL1 145 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 PROP1O75360 226 aa6.78□□□□□ -1.32
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PDE4D-208ENST00000502484 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 PJVKQ0ZLH3 352 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 CLINT1Q14677 625 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 OR2B11Q5JQS5 317 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 BTNL8Q6UX41 500 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 Q6ZRG5 221 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 TCF23Q7RTU1 214 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 DEFB108BQ8NET1 73 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 BPIFCQ8NFQ6 507 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-208ENST00000502484 CORO2AQ92828 525 aa6.78□□□□□ -1.32
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