RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 SCPEP1Q9HB40 452 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 ETAA1Q9NY74 926 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 GABARAPH6UMI1 98 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 SULT1C2O00338 296 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 HSD17B6O14756 317 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 LANCL1O43813 399 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 CD3GP09693 182 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 IGHV3-43DP0DP04 118 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 RAB7AP51149 207 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 ARFRP1Q13795 201 aa9.95□□□□□ -0.82
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PRAME-212ENST00000485532 MOB3BQ86TA1 216 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 OR8H3Q8N146 312 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 GAPTQ8N292 157 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 Q8N402 240 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 OR10X1Q8NGY0 326 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 CCDC107Q8WV48 283 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 TRIM63Q969Q1 353 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa9.95□□□□□ -0.82
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PRAME-212ENST00000485532 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 KLK11Q9UBX7 282 aa9.93□□□□□ -0.82
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PRAME-212ENST00000485532 UPK1BO75841 260 aa9.92□□□□□ -0.82
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PRAME-212ENST00000485532 NAT1P18440 290 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 CBX5P45973 191 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 RAB25P57735 213 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 EBI3Q14213 229 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 ZNF880Q6PDB4 577 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 C5orf24Q7Z6I8 188 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 Q8N6K4 173 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 Q8N9W7 124 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 PLSCR3Q9NRY6 295 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 GFOD1Q9NXC2 390 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 RBBP9O75884 186 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 GZMHP20718 246 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 RCVRNP35243 200 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 MYCNOSP40205 109 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 GPR12P47775 334 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 SLC35B1P78383 322 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 CD69Q07108 199 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 TRIQKQ629K1 86 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 HOGA1Q86XE5 327 aa9.91□□□□□ -0.82
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