RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368358.3

HCN3-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN3, Length 3,718 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3-201ENST00000368358 AQP10Q96PS8 301 aa11.2□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 C12orf77C9JDV5 145 aa11.19□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 SPINT2O43291 252 aa11.19□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP11.19□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 CLDN1O95832 211 aa11.19□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 IGHV1-46P01743 117 aa11.19□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 VDAC1P21796 283 aa11.19□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 CDSNQ15517 529 aa11.19□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 LAMP3Q9UQV4 416 aa11.19□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 FBXO7Q9Y3I1 522 aa11.19□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 THBDP07204 575 aa11.19□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 SFTPCP11686 197 aa11.19□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 LPAR6P43657 344 aa11.19□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 ADIPOQQ15848 244 aa11.19□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa11.19□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 ZFP57Q9NU63 452 aa11.19□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 METTL15P1P0C7V9 234 aa11.19□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 KITLGP21583 273 aa11.19□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 AVPI1Q5T686 147 aa11.19□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 STX12Q86Y82 276 aa11.19□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 LILRB2Q8N423 598 aa11.19□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 OR2G3Q8NGZ4 309 aa11.19□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 CYTL1Q9NRR1 136 aa11.19□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 RNF115Q9Y4L5 304 aa11.19□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 TXNL1O43396 289 aa11.18□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 G6PCP35575 357 aa11.18□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 UCP3P55916 312 aa11.18□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 RUNX1Q01196 453 aa11.18□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 SPAG16Q8N0X2 631 aa11.18□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 CD300LFQ8TDQ1 290 aa11.18□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 TUBD1Q9UJT1 453 aa11.18□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 ABCA12Q86UK0 2595 aa11.18□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 TAAR5O14804 337 aa11.18□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 GPR137BO60478 399 aa11.18□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP11.18□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 PCSK4Q6UW60 755 aa11.18□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 LINC00596Q86U02 117 aa11.18□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 MUC15Q8N387 334 aa11.18□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 OR13A1Q8NGR1 328 aa11.18□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 PHYHIPLQ96FC7 376 aa11.18□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 UBTD1Q9HAC8 227 aa11.18□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 IGSF10Q6WRI0 2623 aa11.18□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 USP24Q9UPU5 2620 aa11.18□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 MDH2P40926 338 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 DRAM1Q8N682 238 aa11.18□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 GCSAMQ8N6F7 178 aa11.18□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 GPR146Q96CH1 333 aa11.18□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 C18orf12Q96KH6 178 aa11.18□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 REG4Q9BYZ8 158 aa11.18□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa11.17□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 PRSS44E7EML9 344 aa11.17□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 ZP3P21754 424 aa11.17□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 AKR1C3P42330 323 aa11.17□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 DYNLT3P51808 116 aa11.17□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 DMBX1Q8NFW5 382 aa11.17□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 SLC25A31Q9H0C2 315 aa11.17□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 RHOFQ9HBH0 211 aa11.17□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 LPAR3Q9UBY5 353 aa11.17□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 LRBAP50851 2863 aa11.17□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 ATRAIDQ6UW56 229 aa11.17□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 ZNF497Q6ZNH5 498 aa11.17□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 FGFRL1Q8N441 504 aa11.17□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 SCGB1C1Q8TD33 95 aa11.17□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 C20orf24Q9BUV8 137 aa11.17□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 M0R036 132 aa11.17□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 IFNA5P01569 189 aa11.17□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 GCM1Q9NP62 436 aa11.17□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 POMT1Q9Y6A1 747 aa11.17□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 TLN2Q9Y4G6 2542 aa11.16□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 CEBPZOSA8MTT3 80 aa11.16□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 GPR37O15354 613 aa11.16□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 IFNA17P01571 189 aa11.16□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 GPR12P47775 334 aa11.16□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 MIDNQ504T8 468 aa11.16□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 MOB1BQ7L9L4 216 aa11.16□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 THNSL2Q86YJ6 484 aa11.16□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 FLNCQ14315 2725 aa11.16□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 A0A0G2JRQ6 117 aa11.16□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 C17orf100A8MU93 164 aa11.16□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 E7EQL1 145 aa11.16□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 ERVFRD-1P60508 538 aa11.16□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 NUP50Q9UKX7 468 aa11.16□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 A1L4Q6 167 aa11.16□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 OOEPA6NGQ2 149 aa11.16□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 CDS2O95674 445 aa11.16□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 HFEQ30201 348 aa11.16□□□□□ -0.62
HCN3-201ENST00000368358 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 112.1 ms