Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

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Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GCSAMQ8N6F7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GCSAMQ8N6F7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GCSAMQ8N6F7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GCSAMQ8N6F7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GCSAMQ8N6F7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GCSAMQ8N6F7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GCSAMQ8N6F7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
GCSAMQ8N6F7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GCSAMQ8N6F7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GCSAMQ8N6F7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GCSAMQ8N6F7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GCSAMQ8N6F7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GCSAMQ8N6F7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GCSAMQ8N6F7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCSAMQ8N6F7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GCSAMQ8N6F7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GCSAMQ8N6F7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCSAMQ8N6F7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCSAMQ8N6F7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCSAMQ8N6F7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCSAMQ8N6F7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCSAMQ8N6F7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCSAMQ8N6F7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCSAMQ8N6F7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCSAMQ8N6F7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCSAMQ8N6F7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCSAMQ8N6F7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCSAMQ8N6F7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCSAMQ8N6F7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GCSAMQ8N6F7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCSAMQ8N6F7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCSAMQ8N6F7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCSAMQ8N6F7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCSAMQ8N6F7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCSAMQ8N6F7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCSAMQ8N6F7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCSAMQ8N6F7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCSAMQ8N6F7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCSAMQ8N6F7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCSAMQ8N6F7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCSAMQ8N6F7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCSAMQ8N6F7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCSAMQ8N6F7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCSAMQ8N6F7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCSAMQ8N6F7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCSAMQ8N6F7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCSAMQ8N6F7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCSAMQ8N6F7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCSAMQ8N6F7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCSAMQ8N6F7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCSAMQ8N6F7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCSAMQ8N6F7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCSAMQ8N6F7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GCSAMQ8N6F7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCSAMQ8N6F7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCSAMQ8N6F7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCSAMQ8N6F7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCSAMQ8N6F7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCSAMQ8N6F7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCSAMQ8N6F7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCSAMQ8N6F7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCSAMQ8N6F7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCSAMQ8N6F7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCSAMQ8N6F7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCSAMQ8N6F7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCSAMQ8N6F7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCSAMQ8N6F7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCSAMQ8N6F7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCSAMQ8N6F7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCSAMQ8N6F7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GCSAMQ8N6F7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCSAMQ8N6F7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCSAMQ8N6F7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCSAMQ8N6F7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCSAMQ8N6F7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCSAMQ8N6F7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GCSAMQ8N6F7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCSAMQ8N6F7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCSAMQ8N6F7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCSAMQ8N6F7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCSAMQ8N6F7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCSAMQ8N6F7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GCSAMQ8N6F7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GCSAMQ8N6F7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCSAMQ8N6F7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCSAMQ8N6F7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCSAMQ8N6F7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCSAMQ8N6F7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCSAMQ8N6F7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCSAMQ8N6F7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCSAMQ8N6F7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCSAMQ8N6F7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCSAMQ8N6F7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCSAMQ8N6F7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GCSAMQ8N6F7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCSAMQ8N6F7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCSAMQ8N6F7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCSAMQ8N6F7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCSAMQ8N6F7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
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