RNA–Protein interactions for RNA: YOR145C

PNO1, Transcript of Essential nucleolar protein required for pre-18S rRNA processing, yeast

Gene PNO1, Length 825 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PNO1	YOR145C	PRP28	P23394	588 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PNO1	YOR145C	YBR071W	P38243	211 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PNO1	YOR145C	PAF1	P38351	445 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PNO1	YOR145C	BIT61	P47041	543 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PNO1	YOR145C	SPC105	P53148	917 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PNO1	YOR145C	SLI1	P53304	468 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PNO1	YOR145C	MUK1	Q02866	612 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PNO1	YOR145C	YPS7	Q06325	596 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PNO1	YOR145C	THI22	Q06490	572 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PNO1	YOR145C	YPR027C	Q12079	277 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PNO1	YOR145C	SIR3	P06701	978 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PNO1	YOR145C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PNO1	YOR145C	DGR2	P32330	852 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PNO1	YOR145C	BCS1	P32839	456 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PNO1	YOR145C	BIT2	P38346	545 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PNO1	YOR145C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PNO1	YOR145C	YJR120W	P47157	116 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PNO1	YOR145C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PNO1	YOR145C	FOL1	P53848	824 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PNO1	YOR145C	ABF1	P14164	731 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PNO1	YOR145C	CDC43	P18898	376 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PNO1	YOR145C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PNO1	YOR145C	DAL3	P32459	195 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PNO1	YOR145C	PHO11	P35842	467 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PNO1	YOR145C	FAT1	P38225	669 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PNO1	YOR145C	PHO12	P38693	467 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PNO1	YOR145C	YIL077C	P40508	320 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PNO1	YOR145C	VID28	P40547	921 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PNO1	YOR145C	SLD3	P53135	668 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PNO1	YOR145C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PNO1	YOR145C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PNO1	YOR145C	NTH1	P32356	751 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PNO1	YOR145C	TOM20	P35180	183 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PNO1	YOR145C	COS111	P38308	924 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PNO1	YOR145C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
PNO1	YOR145C	EMP65	P40085	556 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PNO1	YOR145C	ARG2	P40360	574 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PNO1	YOR145C	NIT2	P47016	307 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PNO1	YOR145C	TAF4	P50105	388 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PNO1	YOR145C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PNO1	YOR145C	STP4	Q07351	490 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PNO1	YOR145C	KAR1	P11927	433 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	YPT7	P32939	208 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	PEA2	P40091	420 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	NDC80	P40460	691 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	BUD8	P41698	603 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	IES1	P43579	692 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	CTR1	P49573	406 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	PEX14	P53112	341 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	FHN1	P53279	174 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	NSE5	Q03718	556 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	YFT2	Q06676	274 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
PNO1	YOR145C	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	IME1	P21190	360 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	YHR033W	P38690	423 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	SPO1	P53541	631 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	ATG4	P53867	494 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	COG6	P53959	839 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	TMN2	Q04562	672 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	MLH3	Q12083	715 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	USV1	Q12132	391 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
PNO1	YOR145C	KIN3	P22209	435 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	SEC6	P32844	805 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	GLG1	P36143	616 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	SDS3	P40505	327 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	STU2	P46675	888 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	MPS3	P47069	682 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	RFX1	P48743	811 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	GND2	P53319	492 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	CDC26	P14724	124 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	YDL086W	Q07505	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	DMC1	P25453	334 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	FUB1	P25659	250 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	PRE4	P30657	266 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	TFC4	P33339	1025 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	MTH1	P35198	433 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	APL3	P38065	1025 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	CTP1	P38152	299 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	YJL206C	P39529	758 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	YGR151C	P53287	111 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	HOL1	P53389	586 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	PEX15	Q08215	383 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	AIM41	Q12032	185 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	ATP12	P22135	325 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	PLC1	P32383	869 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	HXT4	P32467	576 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	KHA1	P40309	873 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PNO1	YOR145C	IRC10	Q08118	586 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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