RNA–Protein interactions for RNA: YLR078C

BOS1, Transcript of v-SNARE (vesicle specific SNAP receptor), yeast

Gene BOS1, Length 735 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BOS1	YLR078C	MRC1	P25588	1096 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	BCS1	P32839	456 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	SEC6	P32844	805 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	PHO11	P35842	467 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	YBR071W	P38243	211 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	BIT2	P38346	545 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	PHO12	P38693	467 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	DUN1	P39009	513 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	PIG2	P40187	538 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	PXA1	P41909	870 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	FHN1	P53279	174 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	IME1	P21190	360 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	AEP2	P22136	580 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	PRP28	P23394	588 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	DAL3	P32459	195 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	IES1	P43579	692 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	YJR120W	P47157	116 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	UBA2	P52488	636 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	SKY1	Q03656	742 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	PPN1	Q04119	674 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	STP4	Q07351	490 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	MLH3	Q12083	715 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	YIL077C	P40508	320 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	VID28	P40547	921 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	BUD8	P41698	603 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	NIT2	P47016	307 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	TMN2	Q04562	672 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	YPR027C	Q12079	277 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BOS1	YLR078C	COS111	P38308	924 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	SDS3	P40505	327 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	COG6	P53959	839 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	NSE5	Q03718	556 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
BOS1	YLR078C	CDC26	P14724	124 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	DGR2	P32330	852 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	NDC80	P40460	691 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	TAF4	P50105	388 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	GND2	P53319	492 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	SPO1	P53541	631 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	FOL1	P53848	824 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	ATG4	P53867	494 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	YFT2	Q06676	274 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
BOS1	YLR078C	ARG2	P40360	574 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	RFX1	P48743	811 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	SPC105	P53148	917 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	USV1	Q12132	391 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	ABF1	P14164	731 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	PRE4	P30657	266 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	NTH1	P32356	751 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	MTH1	P35198	433 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	MPS3	P47069	682 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	CTR1	P49573	406 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	SLD3	P53135	668 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	CDC43	P18898	376 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	ATP12	P22135	325 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	HXT4	P32467	576 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	TOM20	P35180	183 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	GLG1	P36143	616 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	CTP1	P38152	299 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	YHR033W	P38690	423 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	EMP65	P40085	556 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	STU2	P46675	888 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	PEX14	P53112	341 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	YGR151C	P53287	111 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	IRC10	Q08118	586 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	KIN3	P22209	435 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	FUB1	P25659	250 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	PLC1	P32383	869 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	TFC4	P33339	1025 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	SET3	P36124	751 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	KHA1	P40309	873 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	GIS1	Q03833	894 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	YDL086W	Q07505	273 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BOS1	YLR078C	KAR1	P11927	433 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BOS1	YLR078C	UBS1	P38290	277 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BOS1	YLR078C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
BOS1	YLR078C	YJL206C	P39529	758 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BOS1	YLR078C	PEA2	P40091	420 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BOS1	YLR078C	PRM2	P40534	656 aa		4.77	□□□□□ -1.65

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