RNA–Protein interactions for RNA: YJL114W

YJL114W, Transcript of Retrotransposon TYA Gag gene co-transcribed with TYB Pol, yeast

Gene YJL114W, Length 681 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL114W	YJL114W	YKR051W	P36142	418 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	USV1	Q12132	391 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	KCC4	P25389	1037 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	FUB1	P25659	250 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	GMH1	P36125	273 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	MUP3	P38734	546 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	YJR120W	P47157	116 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	MRK1	P50873	501 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	MNN4	P36044	1178 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	YKR018C	P36114	725 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	YBR071W	P38243	211 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	RIM13	Q03792	727 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	SEG1	Q04279	960 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	ABF1	P14164	731 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	PEX1	P24004	1043 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	TDA3	P38758	523 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	RET2	P43621	546 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	COX18	P53239	316 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	PTP1	P25044	335 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	DID4	P36108	232 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	GET2	P40056	285 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	YGR153W	P48238	217 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	PCL10	P53124	433 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	SPC98	P53540	846 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	COG6	P53959	839 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	ECM9	Q02202	377 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	TRE2	Q08693	809 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YJL114W	YJL114W	GRX7	P38068	203 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	YGR151C	P53287	111 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	ARP4	P80428	489 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	OSW1	Q08692	278 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	DCS2	Q12123	353 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	ERG11	P10614	530 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	SET3	P36124	751 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	MAL31	P38156	614 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	HXT7	P39004	570 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	PIG2	P40187	538 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	YJR008W	P47085	338 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	PEX8	P53248	589 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	FMP30	Q02883	468 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	AEP2	P22136	580 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	PRP28	P23394	588 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	DAL3	P32459	195 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	NIT2	P47016	307 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	BFA1	P47113	574 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	HFI1	Q12060	488 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	STE12	P13574	688 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	PLC1	P32383	869 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	BCS1	P32839	456 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	GID8	P40208	455 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	GAT1	P43574	510 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	PEX14	P53112	341 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	YHM2	Q04013	314 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	RMP1	Q12530	201 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	ECM3	Q99252	613 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	SEC65	P29478	273 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	OAF3	P36023	863 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	YKR075C	P36155	307 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	BIT2	P38346	545 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	YHR202W	P38887	602 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	BEM4	P39011	633 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	ATG36	P46983	293 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	YDL086W	Q07505	273 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YJL114W	YJL114W	APM4	Q99186	491 aa		4.04	□□□□□ -1.76

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