RNA–Protein interactions for RNA: YJL038C

LOH1, Transcript of Protein involved in outer spore wall assembly, yeast

Gene LOH1, Length 660 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LOH1	YJL038C	YBL028C	P38202	106 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	SHC1	P39000	512 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	STU2	P46675	888 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	SIZ1	Q04195	904 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	SKG3	Q06315	1026 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	APL4	Q12028	832 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	TIP41	Q12199	356 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	ENA1	P13587	1091 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	HIR1	P32479	840 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	YET1	P35723	206 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	RTT107	P38850	1070 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	UBA2	P52488	636 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	VPS4	P52917	437 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	YGR053C	P53234	283 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	CWC24	P53769	259 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	RTC4	P53850	401 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	VPS75	P53853	264 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	ENA2	Q01896	1091 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	TMA10	Q06177	86 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	ESC2	Q06340	456 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	ENA5	Q12691	1091 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	MSM1	P22438	575 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	EMC1	P25574	760 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	SEC65	P29478	273 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	PSO2	P30620	661 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	LST4	P34239	828 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	PET10	P36139	283 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	PXL1	P36166	706 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	PCH2	P38126	564 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	CST26	P38226	397 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	ERG7	P38604	731 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	NDT80	P38830	627 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	VPS45	P38932	577 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	ZRG8	P40021	1076 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	MAD1	P40957	749 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	YGR153W	P48238	217 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	RET3	P53600	189 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	YAP6	Q03935	383 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	CRF1	Q04930	467 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	YOL075C	Q08234	1294 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	OSW2	Q12202	724 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	GIN4	Q12263	1142 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	TUS1	Q06412	1307 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	PHO13	P19881	312 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	CLN2	P20438	545 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	MRC1	P25588	1096 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.78	□□□□□ -1.64	not detected
LOH1	YJL038C	BCD1	P38772	366 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	CTM1	P38818	585 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	SPT8	P38915	602 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.78	□□□□□ -1.64	not detected
LOH1	YJL038C	VAC8	P39968	578 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	THI6	P41835	540 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.78	□□□□□ -1.64	not detected
LOH1	YJL038C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	CSM3	Q04659	317 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	ADY4	Q05955	493 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	XYL2	Q07993	356 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	TLG2	Q08144	397 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LOH1	YJL038C	FOB1	O13329	566 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LOH1	YJL038C	CBP1	P07252	654 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LOH1	YJL038C	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LOH1	YJL038C	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LOH1	YJL038C	RAD53	P22216	821 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LOH1	YJL038C	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LOH1	YJL038C	SAS3	P34218	831 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LOH1	YJL038C	RPC25	P35718	212 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LOH1	YJL038C	SAP190	P36123	1033 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LOH1	YJL038C	POA1	P38218	177 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LOH1	YJL038C	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LOH1	YJL038C	TPM2	P40414	161 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LOH1	YJL038C	MND2	P40577	368 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LOH1	YJL038C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LOH1	YJL038C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65

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