RNA–Protein interactions for RNA: YER104W

RTT105, Transcript of Protein with a role in regulation of Ty1 transposition, yeastyeast

Gene RTT105, Length 627 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTT105YER104W ACF2Q12168 779 aa3.57□□□□□ -1.84
RTT105YER104W YLR149CQ99296 730 aa3.57□□□□□ -1.84
RTT105YER104W SED4P25365 1065 aa3.56□□□□□ -1.84
RTT105YER104W MSH1P25846 959 aa3.56□□□□□ -1.84
RTT105YER104W MCM10P32354 571 aa3.56□□□□□ -1.84
RTT105YER104W MTH1P35198 433 aa3.56□□□□□ -1.84
RTT105YER104W MNN4P36044 1178 aa3.56□□□□□ -1.84
RTT105YER104W SDS22P36047 338 aa3.56□□□□□ -1.84
RTT105YER104W PSY4P38193 441 aa3.56□□□□□ -1.84
RTT105YER104W FAT1P38225 669 aa3.56□□□□□ -1.84
RTT105YER104W SAW1P39735 261 aa3.56□□□□□ -1.84
RTT105YER104W RPT2P40327 437 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RTT105YER104W YIL108WP40483 696 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RTT105YER104W MNT3P40549 630 aa3.56□□□□□ -1.84
RTT105YER104W YJR039WP47107 1121 aa3.56□□□□□ -1.84
RTT105YER104W ASK10P48361 1146 aa3.56□□□□□ -1.84
RTT105YER104W PUS2P53167 370 aa3.56□□□□□ -1.84
RTT105YER104W TEP1P53916 434 aa3.56□□□□□ -1.84
RTT105YER104W CEG1Q01159 459 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RTT105YER104W YMR206WQ03695 313 aa3.56□□□□□ -1.84
RTT105YER104W SSL1Q04673 461 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RTT105YER104W YOR022CQ12204 715 aa3.56□□□□□ -1.84
RTT105YER104W ARP7Q12406 477 aa3.56□□□□□ -1.84
RTT105YER104W YOL087CQ99247 1116 aa3.56□□□□□ -1.84
RTT105YER104W SSM4P40318 1319 aa3.55□□□□□ -1.84
RTT105YER104W INH1P01097 85 aa3.55□□□□□ -1.84
RTT105YER104W PHO3P24031 467 aa3.55□□□□□ -1.84
RTT105YER104W CAD1P24813 409 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RTT105YER104W CHS3P29465 1165 aa3.55□□□□□ -1.84
RTT105YER104W IMP2'P32351 346 aa3.55□□□□□ -1.84
RTT105YER104W BEM3P32873 1128 aa3.55□□□□□ -1.84
RTT105YER104W YKR075CP36155 307 aa3.55□□□□□ -1.84
RTT105YER104W SSZ1P38788 538 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RTT105YER104W TMA108P40462 946 aa3.55□□□□□ -1.84
RTT105YER104W HOS4P40480 1083 aa3.55□□□□□ -1.84
RTT105YER104W ERR3P42222 437 aa3.55□□□□□ -1.84
RTT105YER104W SRB7P47822 140 aa3.55□□□□□ -1.84
RTT105YER104W PUS4P48567 403 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RTT105YER104W ZIP2P53061 704 aa3.55□□□□□ -1.84
RTT105YER104W YMR018WQ04364 514 aa3.55□□□□□ -1.84
RTT105YER104W PSF3Q12146 194 aa3.55□□□□□ -1.84
RTT105YER104W UPC2Q12151 913 aa3.55□□□□□ -1.84
RTT105YER104W HAL9Q12180 1030 aa3.55□□□□□ -1.84
RTT105YER104W ERP4Q12450 207 aa3.55□□□□□ -1.84
RTT105YER104W Q0142Q9ZZW4 58 aa3.55□□□□□ -1.84
RTT105YER104W ATP12P22135 325 aa3.54□□□□□ -1.84
RTT105YER104W RER1P25560 188 aa3.54□□□□□ -1.84
RTT105YER104W KAR4P25583 335 aa3.54□□□□□ -1.84
RTT105YER104W NGG1P32494 702 aa3.54□□□□□ -1.84
RTT105YER104W SRP68P38687 599 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RTT105YER104W BEM4P39011 633 aa3.54□□□□□ -1.84
RTT105YER104W STL1P39932 569 aa3.54□□□□□ -1.84
RTT105YER104W RAD26P40352 1085 aa3.54□□□□□ -1.84
RTT105YER104W YIL092WP40497 633 aa3.54□□□□□ -1.84
RTT105YER104W ENP2P48234 707 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RTT105YER104W GND2P53319 492 aa3.54□□□□□ -1.84
RTT105YER104W DUS1P53759 423 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RTT105YER104W GPD1Q00055 391 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RTT105YER104W MTD1Q02046 320 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RTT105YER104W CIA1Q05583 330 aa3.54□□□□□ -1.84
RTT105YER104W TSR2Q06672 205 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RTT105YER104W HIM1Q06674 414 aa3.54□□□□□ -1.84
RTT105YER104W NUR1Q12066 484 aa3.54□□□□□ -1.84
RTT105YER104W CDC31P06704 161 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RTT105YER104W FBP1P09201 348 aa3.53□□□□□ -1.84
RTT105YER104W GFA1P14742 717 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RTT105YER104W SEC18P18759 758 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RTT105YER104W HXT4P32467 576 aa3.53□□□□□ -1.84
RTT105YER104W XRS2P33301 854 aa3.53□□□□□ -1.84
RTT105YER104W PPE1P38796 400 aa3.53□□□□□ -1.84
RTT105YER104W VID28P40547 921 aa3.53□□□□□ -1.84
RTT105YER104W BRE5P53741 515 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RTT105YER104W ARP4P80428 489 aa3.53□□□□□ -1.84
RTT105YER104W SEC5P89102 971 aa3.53□□□□□ -1.84
RTT105YER104W YDR056CQ12025 205 aa3.53□□□□□ -1.84
RTT105YER104W CWC2Q12046 339 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RTT105YER104W CLF1Q12309 687 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RTT105YER104W MED1Q12321 566 aa3.53□□□□□ -1.84
RTT105YER104W RPS17AP02407 136 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RTT105YER104W RPS17BP14127 136 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RTT105YER104W CDC26P14724 124 aa3.52□□□□□ -1.85
RTT105YER104W ACO1P19414 778 aaKnown RBP RIP-Chip data3.52□□□□□ -1.85not detected
RTT105YER104W ERG4P25340 473 aa3.52□□□□□ -1.85
RTT105YER104W NFU1P32860 256 aa3.52□□□□□ -1.85
RTT105YER104W TGL1P34163 548 aa3.52□□□□□ -1.85
RTT105YER104W RRN3P36070 627 aa3.52□□□□□ -1.85
RTT105YER104W TAF5P38129 798 aa3.52□□□□□ -1.85
RTT105YER104W MIP6P38760 659 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RTT105YER104W CTF8P38877 133 aa3.52□□□□□ -1.85
RTT105YER104W SSP120P39931 234 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RTT105YER104W EAF5P39995 279 aa3.52□□□□□ -1.85
RTT105YER104W KAP123P40069 1113 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RTT105YER104W IRC5P43610 853 aa3.52□□□□□ -1.85
RTT105YER104W MEP3P53390 489 aa3.52□□□□□ -1.85
RTT105YER104W NOP15P53927 220 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
RTT105YER104W MOT3P54785 490 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RTT105YER104W MUK1Q02866 612 aa3.52□□□□□ -1.85
RTT105YER104W COQ11Q05892 277 aa3.52□□□□□ -1.85
RTT105YER104W YLR407WQ06070 228 aa3.52□□□□□ -1.85
RTT105YER104W NGL1Q08213 363 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
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