RNA–Protein interactions for RNA: YBR228W

SLX1, Transcript of Endonuclease involved in DNA recombination and repair, yeast

Gene SLX1, Length 915 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX1	YBR228W	VMR1	P38735	1592 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	VBA3	P25594	458 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.77	□□□□□ -1.49	not detected
SLX1	YBR228W	ARG2	P40360	574 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	CTR1	P49573	406 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	IMO32	P53219	342 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	COX18	P53239	316 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	ADY2	P25613	283 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	PHO11	P35842	467 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	GLG1	P36143	616 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	FLO10	P36170	1169 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	PHO12	P38693	467 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	RPN4	Q03465	531 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	TAF3	Q12297	353 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	MDM12	Q92328	271 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	DNF3	Q12674	1656 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	MEF1	P25039	761 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	HSL7	P38274	827 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	BDH2	P39713	417 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	NUP82	P40368	713 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	CAF16	P43569	289 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	NHX1	Q04121	633 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	ARO10	Q06408	635 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	REC102	Q02721	264 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	USV1	Q12132	391 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	YLR125W	Q12138	136 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	ZRT2	Q12436	422 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	PHO8	P11491	566 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	HOG1	P32485	435 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	GET2	P40056	285 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	PCL10	P53124	433 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	IML1	P47170	1584 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	CIT2	P08679	460 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	SRD1	P09007	221 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	RAD18	P10862	487 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	EMP70	P32802	667 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	FHN1	P53279	174 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	ATG4	P53867	494 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	MLH3	Q12083	715 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	ECM3	Q99252	613 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLX1	YBR228W	MIH1	P23748	554 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SLX1	YBR228W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SLX1	YBR228W	MDM10	P18409	493 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SLX1	YBR228W	THI4	P32318	326 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SLX1	YBR228W	YKR018C	P36114	725 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SLX1	YBR228W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
SLX1	YBR228W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
SLX1	YBR228W	UBS1	P38290	277 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SLX1	YBR228W	YAP3	P38749	330 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SLX1	YBR228W	YEL020C	P39994	560 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SLX1	YBR228W	YNL195C	P40168	261 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SLX1	YBR228W	BUD6	P41697	788 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SLX1	YBR228W	ARP4	P80428	489 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SLX1	YBR228W	COQ11	Q05892	277 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SLX1	YBR228W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
SLX1	YBR228W	PDR11	P40550	1411 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SLX1	YBR228W	RPN13	O13563	156 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SLX1	YBR228W	SNM1	P40993	198 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SLX1	YBR228W	THI7	Q05998	598 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SLX1	YBR228W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
SLX1	YBR228W	USO1	P25386	1790 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SLX1	YBR228W	OCA5	P38738	679 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SLX1	YBR228W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
SLX1	YBR228W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
SLX1	YBR228W	HAP1	P0CE41	1502 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SLX1	YBR228W	PEX1	P24004	1043 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SLX1	YBR228W	MSH2	P25847	964 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SLX1	YBR228W	PEX6	P33760	1030 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SLX1	YBR228W	SET3	P36124	751 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SLX1	YBR228W	AIM14	P53109	570 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SLX1	YBR228W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
SLX1	YBR228W	FUB1	P25659	250 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SLX1	YBR228W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
SLX1	YBR228W	APN2	P38207	520 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SLX1	YBR228W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
SLX1	YBR228W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
SLX1	YBR228W	GMH1	P36125	273 aa		5.64	□□□□□ -1.51
SLX1	YBR228W	PIG2	P40187	538 aa		5.64	□□□□□ -1.51
SLX1	YBR228W	UGO1	Q03327	502 aa		5.64	□□□□□ -1.51
SLX1	YBR228W	HOF1	Q05080	669 aa		5.64	□□□□□ -1.51
SLX1	YBR228W	AFT2	Q08957	416 aa		5.64	□□□□□ -1.51
SLX1	YBR228W	NUP192	P47054	1683 aa		5.63	□□□□□ -1.51
SLX1	YBR228W	HMG1	P12683	1054 aa		5.63	□□□□□ -1.51
SLX1	YBR228W	BCS1	P32839	456 aa		5.63	□□□□□ -1.51
SLX1	YBR228W	MNN4	P36044	1178 aa		5.63	□□□□□ -1.51
SLX1	YBR228W	MUP3	P38734	546 aa		5.63	□□□□□ -1.51
SLX1	YBR228W	GID8	P40208	455 aa		5.63	□□□□□ -1.51
SLX1	YBR228W	YGR151C	P53287	111 aa		5.63	□□□□□ -1.51
SLX1	YBR228W	SPC98	P53540	846 aa		5.63	□□□□□ -1.51
SLX1	YBR228W	THI22	Q06490	572 aa		5.63	□□□□□ -1.51

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