RNA–Protein interactions for RNA: YBL009W

ALK2, Transcript of Protein kinase, yeast

Gene ALK2, Length 2,031 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ALK2	YBL009W	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ALK2	YBL009W	YJR008W	P47085	338 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ALK2	YBL009W	DNM1	P54861	757 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ALK2	YBL009W	UGO1	Q03327	502 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ALK2	YBL009W	VPS64	Q03944	604 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ALK2	YBL009W	CRR1	Q05790	422 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ALK2	YBL009W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ALK2	YBL009W	PUS9	Q12069	462 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ALK2	YBL009W	PMD1	P32634	1753 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ALK2	YBL009W	DIF1	O13577	133 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ALK2	YBL009W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
ALK2	YBL009W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
ALK2	YBL009W	SWC3	P31376	625 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ALK2	YBL009W	RAD24	P32641	659 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ALK2	YBL009W	NUP133	P36161	1157 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ALK2	YBL009W	RPP1	P38786	293 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ALK2	YBL009W	CSI1	Q04368	295 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ALK2	YBL009W	SWM1	Q12379	170 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ALK2	YBL009W	RAD18	P10862	487 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ALK2	YBL009W	PCL2	P25693	308 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ALK2	YBL009W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
ALK2	YBL009W	PPG1	P32838	368 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ALK2	YBL009W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
ALK2	YBL009W	FKH2	P41813	862 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ALK2	YBL009W	SHR5	P41912	237 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ALK2	YBL009W	OSW7	P43611	510 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ALK2	YBL009W	MSE1	P48525	536 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ALK2	YBL009W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
ALK2	YBL009W	FCP1	Q03254	732 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ALK2	YBL009W	CTI6	Q08923	506 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ALK2	YBL009W	TRM11	Q12463	433 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ALK2	YBL009W	YLR415C	O13578	112 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	ERG4	P25340	473 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	YKR051W	P36142	418 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	2.65	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	HMG1	P12683	1054 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	HOG1	P32485	435 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	SIC1	P38634	284 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	UBP12	P39538	1254 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	PZF1	P39933	429 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	AIM21	P40563	679 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	AIM14	P53109	570 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	ARP4	P80428	489 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	TFB2	Q02939	513 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	TGL5	Q12043	749 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	GSY1	P23337	708 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	YBR053C	P38235	358 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	MNN1	P39106	762 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	BNA2	P47125	453 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	EAF6	P47128	113 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	MUP1	P50276	574 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	SPO1	P53541	631 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	YNL193W	P53870	558 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	PKH1	Q03407	766 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	ATG33	Q06485	197 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	AIM39	Q08223	395 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	YOL073C	Q08232	322 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	SAC3	P46674	1301 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	SFL1	P20134	766 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	2.63	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	MET13	P53128	600 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	UBP16	Q02863	499 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	HKR1	P41809	1802 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	PFF1	P38244	976 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	SUL1	P38359	859 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	HOS4	P40480	1083 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	2.63	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	MUK1	Q02866	612 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	NRG1	Q03125	231 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	NHX1	Q04121	633 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	2.63	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	ALG7	P07286	448 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	KTR4	P38131	464 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	ELO3	P40319	345 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	NPY1	P53164	384 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	ERO1	Q03103	563 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	FRE5	Q08908	694 aa		2.62	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	FIG2	P25653	1609 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ALK2	YBL009W	CTT1	P06115	562 aa		2.61	□□□□□ -1.99

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