RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639599.1

TARDBP-231, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 1,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	18.53	■□□□□ 0.56
TARDBP-231	ENST00000639599	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		18.53	■□□□□ 0.56
TARDBP-231	ENST00000639599	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	18.52	■□□□□ 0.56
TARDBP-231	ENST00000639599	CFAP100	Q494V2	611 aa		18.52	■□□□□ 0.56
TARDBP-231	ENST00000639599	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		18.52	■□□□□ 0.56
TARDBP-231	ENST00000639599	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	18.52	■□□□□ 0.56
TARDBP-231	ENST00000639599	JAG2	Q9Y219	1238 aa		18.52	■□□□□ 0.56
TARDBP-231	ENST00000639599	PSME4	Q14997	1843 aa		18.51	■□□□□ 0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	CLRN2	A0PK11	232 aa		18.51	■□□□□ 0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	18.51	■□□□□ 0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	IL1R1	P14778	569 aa		18.51	■□□□□ 0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		18.51	■□□□□ 0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	TBC1D8	O95759	1140 aa		18.5	■□□□□ 0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	18.5	■□□□□ 0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	TNFAIP1	Q13829	316 aa		18.5	■□□□□ 0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		18.5	■□□□□ 0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		18.5	■□□□□ 0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	18.49	■□□□□ 0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	18.49	■□□□□ 0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	UBE4A	Q14139	1066 aa		18.49	■□□□□ 0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	18.49	■□□□□ 0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		18.49	■□□□□ 0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	CERS5	Q8N5B7	392 aa		18.49	■□□□□ 0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		18.49	■□□□□ 0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	ALDH1A1	P00352	501 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	SPDYE6	P0CI01	402 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	RGS19	P49795	217 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	SUCLG2	Q96I99	432 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	18.48	■□□□□ 0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	TM4SF4	P48230	202 aa		18.47	■□□□□ 0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	SOX10	P56693	466 aa		18.47	■□□□□ 0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		18.47	■□□□□ 0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	METTL24	Q5JXM2	366 aa		18.47	■□□□□ 0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		18.47	■□□□□ 0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	GYG1	P46976	350 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	SPRYD7	Q5W111	196 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	18.46	■□□□□ 0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	PTPRC	P08575	1304 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TARDBP-231	ENST00000639599	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		18.46	■□□□□ 0.55
TARDBP-231	ENST00000639599		E9PSI1	815 aa		18.45	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	GPR25	O00155	361 aa		18.45	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	TNNI2	P48788	182 aa		18.45	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	INHBE	P58166	350 aa		18.45	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	18.45	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		18.45	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	18.45	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	FKTN	O75072	461 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	18.44	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	18.44	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	18.44	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	FZD1	Q9UP38	647 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	UNCX	A6NJT0	531 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	RASA3	Q14644	834 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	MAP3K11	Q16584	847 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	CACNA1F	O60840	1977 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	WNK4	Q96J92	1243 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	CRK	P46108	304 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		18.4	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		18.4	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	IFNL1	Q8IU54	200 aa		18.4	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		18.4	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		18.4	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		18.4	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	UTY	O14607	1347 aa		18.4	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	MAST3	O60307	1309 aa		18.4	■□□□□ 0.54
TARDBP-231	ENST00000639599	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	18.39	■□□□□ 0.53
TARDBP-231	ENST00000639599	TEKT1	Q969V4	418 aa		18.39	■□□□□ 0.53
TARDBP-231	ENST00000639599	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		18.39	■□□□□ 0.53
TARDBP-231	ENST00000639599	CSAD	Q9Y600	493 aa		18.39	■□□□□ 0.53
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF521	Q96K83	1311 aa		18.39	■□□□□ 0.53
TARDBP-231	ENST00000639599	PDE8B	O95263	885 aa		18.38	■□□□□ 0.53
TARDBP-231	ENST00000639599	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
TARDBP-231	ENST00000639599	LRRC24	Q50LG9	513 aa		18.38	■□□□□ 0.53

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