RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 FLIIQ13045 1269 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-216ENST00000628306 CD209Q9NNX6 404 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-216ENST00000628306 FZD1Q9UP38 647 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-216ENST00000628306 CENPFP49454 3210 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-216ENST00000628306 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
CAPNS1-216ENST00000628306 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.47
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa30.51■■■□□ 2.47
CAPNS1-216ENST00000628306 NF2P35240 595 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-216ENST00000628306 PRKG1Q13976 671 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-216ENST00000628306 SPRYD7Q5W111 196 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-216ENST00000628306 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-216ENST00000628306 HDAC9Q9UKV0 1011 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-216ENST00000628306 ARMC9Q7Z3E5 817 aa30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAAF4Q8WXU2 420 aa30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-216ENST00000628306 MPHOSPH8Q99549 860 aa30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-216ENST00000628306 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-216ENST00000628306 AOX1Q06278 1338 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-216ENST00000628306 MTMR14Q8NCE2 650 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-216ENST00000628306 LINS1Q8NG48 757 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-216ENST00000628306 LAMB1P07942 1786 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-216ENST00000628306 FOXO4P98177 505 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-216ENST00000628306 SREBF2Q12772 1141 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-216ENST00000628306 MAP3K11Q16584 847 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-216ENST00000628306 DEFB129Q9H1M3 183 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-216ENST00000628306 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-216ENST00000628306 TAF5LO75529 589 aa30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-216ENST00000628306 ECM29Q5VYK3 1845 aa30.45■■■□□ 2.46
CAPNS1-216ENST00000628306 BRCA2P51587 3418 aa30.45■■■□□ 2.46
CAPNS1-216ENST00000628306 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
CAPNS1-216ENST00000628306 CACNA1FO60840 1977 aa30.43■■■□□ 2.46
CAPNS1-216ENST00000628306 FKTNO75072 461 aa30.43■■■□□ 2.46
CAPNS1-216ENST00000628306 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
CAPNS1-216ENST00000628306 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
CAPNS1-216ENST00000628306 FANCIQ9NVI1 1328 aa30.43■■■□□ 2.46
CAPNS1-216ENST00000628306 IL1R1P14778 569 aa30.42■■■□□ 2.46
CAPNS1-216ENST00000628306 RRP1P56182 461 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
CAPNS1-216ENST00000628306 CLMNQ96JQ2 1002 aa30.42■■■□□ 2.46
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDH10Q9P2E7 1040 aa30.42■■■□□ 2.46
CAPNS1-216ENST00000628306 VAMP4O75379 141 aa30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-216ENST00000628306 DLGAP5Q15398 846 aa30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNJ4P48050 445 aa30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-216ENST00000628306 EPHA10Q5JZY3 1008 aa30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-216ENST00000628306 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-216ENST00000628306 SPDYE2BA6NHP3 402 aa30.39■■■□□ 2.45
CAPNS1-216ENST00000628306 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP30.39■■■□□ 2.455e-7■■■■□ 22.6
CAPNS1-216ENST00000628306 SPDYE6P0CI01 402 aa30.39■■■□□ 2.45
CAPNS1-216ENST00000628306 BEND3Q5T5X7 828 aa30.39■■■□□ 2.45
CAPNS1-216ENST00000628306 IFNL1Q8IU54 200 aa30.39■■■□□ 2.45
CAPNS1-216ENST00000628306 WNK4Q96J92 1243 aa30.39■■■□□ 2.45
CAPNS1-216ENST00000628306 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
CAPNS1-216ENST00000628306 CFAP100Q494V2 611 aa30.38■■■□□ 2.45
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa30.38■■■□□ 2.45
CAPNS1-216ENST00000628306 CLRN2A0PK11 232 aa30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-216ENST00000628306 F6X3S4 739 aa30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-216ENST00000628306 GJA5P36382 358 aa30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-216ENST00000628306 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC10A4Q96EP9 437 aa30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-216ENST00000628306 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
CAPNS1-216ENST00000628306 F8W031 263 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
CAPNS1-216ENST00000628306 ALDH1A1P00352 501 aa30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-216ENST00000628306 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-216ENST00000628306 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-216ENST00000628306 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-216ENST00000628306 JAG2Q9Y219 1238 aa30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-216ENST00000628306 INHBEP58166 350 aa30.34■■■□□ 2.45
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
CAPNS1-216ENST00000628306 USP2O75604 605 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
CAPNS1-216ENST00000628306 LMBR1LQ6UX01 489 aa30.33■■■□□ 2.45
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF804AQ7Z570 1209 aa30.33■■■□□ 2.45
CAPNS1-216ENST00000628306 UNCXA6NJT0 531 aa30.32■■■□□ 2.44
CAPNS1-216ENST00000628306 CAP1Q01518 475 aa30.32■■■□□ 2.44
CAPNS1-216ENST00000628306 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
CAPNS1-216ENST00000628306 OTOP1Q7RTM1 612 aa30.32■■■□□ 2.44
CAPNS1-216ENST00000628306 OTOFQ9HC10 1997 aa30.31■■■□□ 2.44
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM205AQ6ZU69 1335 aa30.31■■■□□ 2.44
CAPNS1-216ENST00000628306 PTPN18Q99952 460 aa30.3■■■□□ 2.44
CAPNS1-216ENST00000628306 RARSP54136 660 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
CAPNS1-216ENST00000628306 RASA3Q14644 834 aa30.29■■■□□ 2.44
CAPNS1-216ENST00000628306 CHMP3Q9Y3E7 222 aa30.29■■■□□ 2.44
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM17Q9Y577 477 aa30.29■■■□□ 2.44
CAPNS1-216ENST00000628306 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-216ENST00000628306 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-216ENST00000628306 VEZTQ9HBM0 779 aa30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-216ENST00000628306 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-216ENST00000628306 GRM8O00222 908 aa30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-216ENST00000628306 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-216ENST00000628306 CDAN1Q8IWY9 1227 aa30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-216ENST00000628306 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-216ENST00000628306 POTEFA5A3E0 1075 aa30.27■■■□□ 2.44
CAPNS1-216ENST00000628306 MYO1BO43795 1136 aa30.27■■■□□ 2.44
CAPNS1-216ENST00000628306 CRHR2Q13324 411 aa30.27■■■□□ 2.44
CAPNS1-216ENST00000628306 SPDYE2Q495Y8 402 aa30.27■■■□□ 2.44
CAPNS1-216ENST00000628306 KAZALD1Q96I82 304 aa30.27■■■□□ 2.44
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP4R2Q9NY27 417 aa30.27■■■□□ 2.44
CAPNS1-216ENST00000628306 TEPSINQ96N21 525 aa30.26■■■□□ 2.43
CAPNS1-216ENST00000628306 ARAP2Q8WZ64 1704 aa30.25■■■□□ 2.43
CAPNS1-216ENST00000628306 PLIN1O60240 522 aa30.25■■■□□ 2.43
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