RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550724.2

HECTD4-212, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 3

Gene HECTD4, Length 587 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-212ENST00000550724 ARHGAP45Q92619 1136 aa18.08■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 WBP1LQ9NX94 342 aa18.08■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 HDAC5Q9UQL6 1122 aa18.08■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 EYA2O00167 538 aa18.07■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 PDE8BO95263 885 aa18.07■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP18.07■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 CAVIN4Q5BKX8 364 aa18.07■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 BEGAINQ9BUH8 593 aa18.07■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa18.06■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa18.06■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 TRIM27P14373 513 aa18.05■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 MMP14P50281 582 aa18.05■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 CFAP100Q494V2 611 aa18.05■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 MFSD14BQ5SR56 506 aa18.05■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 IFFO2Q5TF58 517 aa18.05■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 RGMBQ6NW40 437 aa18.05■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 HHIPL1Q96JK4 782 aa18.05■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa18.05■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 TRPM7Q96QT4 1865 aa18.04■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 GNAI3P08754 354 aa18.04■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 BCAMP50895 628 aa18.04■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 TNS4Q8IZW8 715 aa18.04■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 VGLL2Q8N8G2 317 aa18.04■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 FAM205AQ6ZU69 1335 aa18.03■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 CLRN2A0PK11 232 aa18.03■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 SLC5A1P13866 664 aa18.03■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 MAP2K2P36507 400 aa18.03■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 LBX1P52954 281 aa18.03■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 PRKG1Q13976 671 aa18.03■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa18.03■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 MOB2Q70IA6 237 aa18.03■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 FBXO33Q7Z6M2 555 aa18.03■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 VEZTQ9HBM0 779 aa18.03■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 PCNTO95613 3336 aa18.03■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 PSME4Q14997 1843 aa18.02■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 MYO1BO43795 1136 aa18.02■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 NF2P35240 595 aa18.02■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 ATG9AQ7Z3C6 839 aa18.02■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 CEP126Q9P2H0 1117 aa18.02■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 TSKSQ9UJT2 592 aa18.02■□□□□ 0.48
HECTD4-212ENST00000550724 ZBED9Q6R2W3 1325 aa18.01■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 UBE2Q2LH0YL09 131 aa18.01■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 SRGAP3O43295 1099 aa18.01■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 NOGQ13253 232 aa18.01■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 TMEM57Q8N5G2 664 aa18.01■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 LPIN2Q92539 896 aa18.01■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 ZIC5Q96T25 663 aa18.01■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 A0A1B0GUL6 1792 aa18■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 SPDYE2BA6NHP3 402 aa18■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 CIAO1O76071 339 aa18■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 SPDYE6P0CI01 402 aa18■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 FGFR2P21802 821 aa18■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 ATP2B3Q16720 1220 aa18■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 CCDC102AQ96A19 550 aa18■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 CAPN15O75808 1086 aa17.99■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 GNAI2P04899 355 aa17.99■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 IL15P40933 162 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 GRIK5Q16478 980 aa17.99■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 MTMR14Q8NCE2 650 aa17.99■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 DEFB129Q9H1M3 183 aa17.99■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 AOX1Q06278 1338 aa17.98■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 FKBP1BP68106 108 aa17.98■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa17.98■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 FBXO3Q9UK99 471 aa17.98■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 CRKP46108 304 aa17.97■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 COPRSQ9NQ92 184 aa17.97■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 PRDM10Q9NQV6 1147 aa17.97■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 SERPINA10Q9UK55 444 aa17.97■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 FZD1Q9UP38 647 aa17.97■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 SLC10A3P09131 477 aa17.96■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 ARMC9Q7Z3E5 817 aa17.96■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 RASAL3Q86YV0 1011 aa17.96■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 ITPRIPQ8IWB1 547 aa17.96■□□□□ 0.47
HECTD4-212ENST00000550724 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 101.3 ms