RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512855.5

FAM200B-218, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, human

TSL 5

Gene FAM200B, Length 654 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM200B-218	ENST00000512855	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		28.28	■■■□□ 2.12
FAM200B-218	ENST00000512855	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		28.28	■■■□□ 2.12
FAM200B-218	ENST00000512855	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	28.27	■■■□□ 2.12
FAM200B-218	ENST00000512855	LPIN2	Q92539	896 aa		28.27	■■■□□ 2.12
FAM200B-218	ENST00000512855	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	28.27	■■■□□ 2.12
FAM200B-218	ENST00000512855	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		28.27	■■■□□ 2.12
FAM200B-218	ENST00000512855	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		28.27	■■■□□ 2.12
FAM200B-218	ENST00000512855	JAG2	Q9Y219	1238 aa		28.26	■■■□□ 2.11
FAM200B-218	ENST00000512855	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		28.25	■■■□□ 2.11
FAM200B-218	ENST00000512855	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		28.25	■■■□□ 2.11
FAM200B-218	ENST00000512855	RASSF10	A6NK89	507 aa		28.25	■■■□□ 2.11
FAM200B-218	ENST00000512855	WNT10B	O00744	389 aa		28.25	■■■□□ 2.11
FAM200B-218	ENST00000512855	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	28.25	■■■□□ 2.11
FAM200B-218	ENST00000512855	SLC5A1	P13866	664 aa		28.25	■■■□□ 2.11
FAM200B-218	ENST00000512855	BCAM	P50895	628 aa		28.25	■■■□□ 2.11
FAM200B-218	ENST00000512855	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		28.25	■■■□□ 2.11
FAM200B-218	ENST00000512855	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	28.25	■■■□□ 2.11
FAM200B-218	ENST00000512855	VPS37D	Q86XT2	251 aa		28.25	■■■□□ 2.11
FAM200B-218	ENST00000512855	ADM5	C9JUS6	153 aa		28.24	■■■□□ 2.11
FAM200B-218	ENST00000512855	DLK2	Q6UY11	383 aa		28.24	■■■□□ 2.11
FAM200B-218	ENST00000512855	PANK1	Q8TE04	598 aa		28.24	■■■□□ 2.11
FAM200B-218	ENST00000512855	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	28.24	■■■□□ 2.11
FAM200B-218	ENST00000512855	MS4A1	P11836	297 aa		28.23	■■■□□ 2.11
FAM200B-218	ENST00000512855	ATP2B3	Q16720	1220 aa		28.23	■■■□□ 2.11
FAM200B-218	ENST00000512855	SULF1	Q8IWU6	871 aa		28.23	■■■□□ 2.11
FAM200B-218	ENST00000512855	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	28.23	■■■□□ 2.11
FAM200B-218	ENST00000512855	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		28.23	■■■□□ 2.11
FAM200B-218	ENST00000512855	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		28.22	■■■□□ 2.11
FAM200B-218	ENST00000512855	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		28.22	■■■□□ 2.11
FAM200B-218	ENST00000512855	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	28.22	■■■□□ 2.11
FAM200B-218	ENST00000512855	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		28.22	■■■□□ 2.11
FAM200B-218	ENST00000512855	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		28.21	■■■□□ 2.11
FAM200B-218	ENST00000512855	ATP8B2	P98198	1209 aa		28.2	■■■□□ 2.1
FAM200B-218	ENST00000512855	POLA2	Q14181	598 aa		28.2	■■■□□ 2.1
FAM200B-218	ENST00000512855	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		28.2	■■■□□ 2.1
FAM200B-218	ENST00000512855		F8W031	263 aa	Predicted RBP	28.19	■■■□□ 2.1
FAM200B-218	ENST00000512855	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		28.19	■■■□□ 2.1
FAM200B-218	ENST00000512855	SSH3	Q8TE77	659 aa		28.19	■■■□□ 2.1
FAM200B-218	ENST00000512855	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		28.19	■■■□□ 2.1
FAM200B-218	ENST00000512855	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	28.18	■■■□□ 2.1
FAM200B-218	ENST00000512855	VEGFB	P49765	207 aa		28.18	■■■□□ 2.1
FAM200B-218	ENST00000512855	DLGAP5	Q15398	846 aa		28.18	■■■□□ 2.1
FAM200B-218	ENST00000512855	TFCP2	Q12800	502 aa		28.17	■■■□□ 2.1
FAM200B-218	ENST00000512855	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	28.17	■■■□□ 2.1
FAM200B-218	ENST00000512855	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		28.17	■■■□□ 2.1
FAM200B-218	ENST00000512855	CDCA5	Q96FF9	252 aa		28.17	■■■□□ 2.1
FAM200B-218	ENST00000512855	CFAP100	Q494V2	611 aa		28.16	■■■□□ 2.1
FAM200B-218	ENST00000512855	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		28.16	■■■□□ 2.1
FAM200B-218	ENST00000512855	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		28.15	■■■□□ 2.1
FAM200B-218	ENST00000512855	ZBTB22	O15209	634 aa		28.15	■■■□□ 2.1
FAM200B-218	ENST00000512855	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	28.15	■■■□□ 2.1
FAM200B-218	ENST00000512855	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		28.15	■■■□□ 2.1
FAM200B-218	ENST00000512855	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	28.15	■■■□□ 2.1
FAM200B-218	ENST00000512855	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		28.15	■■■□□ 2.1
FAM200B-218	ENST00000512855	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	28.15	■■■□□ 2.1
FAM200B-218	ENST00000512855	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		28.15	■■■□□ 2.1
FAM200B-218	ENST00000512855	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		28.14	■■■□□ 2.1
FAM200B-218	ENST00000512855	SPDYE6	P0CI01	402 aa		28.14	■■■□□ 2.1
FAM200B-218	ENST00000512855	TIMM10	P62072	90 aa		28.14	■■■□□ 2.1
FAM200B-218	ENST00000512855	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	28.14	■■■□□ 2.1
FAM200B-218	ENST00000512855	GRIK5	Q16478	980 aa		28.14	■■■□□ 2.1
FAM200B-218	ENST00000512855	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		28.14	■■■□□ 2.1
FAM200B-218	ENST00000512855	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	28.14	■■■□□ 2.1
FAM200B-218	ENST00000512855	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	28.14	■■■□□ 2.09
FAM200B-218	ENST00000512855	ADORA1	P30542	326 aa		28.13	■■■□□ 2.09
FAM200B-218	ENST00000512855	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	28.13	■■■□□ 2.09
FAM200B-218	ENST00000512855	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	28.13	■■■□□ 2.09
FAM200B-218	ENST00000512855	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	28.13	■■■□□ 2.09
FAM200B-218	ENST00000512855		A0A1B0GUL7	405 aa		28.12	■■■□□ 2.09
FAM200B-218	ENST00000512855	PHKA1	P46020	1223 aa		28.12	■■■□□ 2.09
FAM200B-218	ENST00000512855	CEP85	Q6P2H3	762 aa		28.12	■■■□□ 2.09
FAM200B-218	ENST00000512855	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	28.12	■■■□□ 2.09
FAM200B-218	ENST00000512855	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		28.12	■■■□□ 2.09
FAM200B-218	ENST00000512855	COG6	Q9Y2V7	657 aa		28.12	■■■□□ 2.09
FAM200B-218	ENST00000512855	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		28.12	■■■□□ 2.09
FAM200B-218	ENST00000512855	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	28.12	■■■□□ 2.09
FAM200B-218	ENST00000512855	CCDC102B	Q68D86	513 aa		28.11	■■■□□ 2.09
FAM200B-218	ENST00000512855	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		28.11	■■■□□ 2.09
FAM200B-218	ENST00000512855	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		28.11	■■■□□ 2.09
FAM200B-218	ENST00000512855	CAPNS2	Q96L46	248 aa		28.11	■■■□□ 2.09
FAM200B-218	ENST00000512855	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	28.11	■■■□□ 2.09
FAM200B-218	ENST00000512855	SEMA3E	O15041	775 aa		28.1	■■■□□ 2.09
FAM200B-218	ENST00000512855	ECE1	P42892	770 aa		28.1	■■■□□ 2.09
FAM200B-218	ENST00000512855	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	28.1	■■■□□ 2.09
FAM200B-218	ENST00000512855	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		28.1	■■■□□ 2.09
FAM200B-218	ENST00000512855	XAGE2	Q96GT9	111 aa		28.1	■■■□□ 2.09
FAM200B-218	ENST00000512855	AOX1	Q06278	1338 aa		28.1	■■■□□ 2.09
FAM200B-218	ENST00000512855	MYO1B	O43795	1136 aa		28.09	■■■□□ 2.09
FAM200B-218	ENST00000512855	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	28.09	■■■□□ 2.09
FAM200B-218	ENST00000512855	PDE3A	Q14432	1141 aa		28.09	■■■□□ 2.09
FAM200B-218	ENST00000512855	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	28.09	■■■□□ 2.09
FAM200B-218	ENST00000512855	MRI	Q9BWK5	157 aa		28.09	■■■□□ 2.09
FAM200B-218	ENST00000512855	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		28.09	■■■□□ 2.09
FAM200B-218	ENST00000512855	CRK	P46108	304 aa		28.08	■■■□□ 2.09
FAM200B-218	ENST00000512855	HUNK	P57058	714 aa		28.08	■■■□□ 2.09
FAM200B-218	ENST00000512855	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		28.08	■■■□□ 2.09
FAM200B-218	ENST00000512855	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		28.08	■■■□□ 2.09
FAM200B-218	ENST00000512855	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		28.08	■■■□□ 2.09
FAM200B-218	ENST00000512855	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	28.07	■■■□□ 2.08
FAM200B-218	ENST00000512855	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	28.07	■■■□□ 2.08

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