RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 RASSF10A6NK89 507 aa29.86■■■□□ 2.37
SMKR1-201ENST00000462322 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
SMKR1-201ENST00000462322 DLK2Q6UY11 383 aa29.86■■■□□ 2.37
SMKR1-201ENST00000462322 FBXO33Q7Z6M2 555 aa29.86■■■□□ 2.37
SMKR1-201ENST00000462322 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
SMKR1-201ENST00000462322 SRGAP3O43295 1099 aa29.85■■■□□ 2.37
SMKR1-201ENST00000462322 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
SMKR1-201ENST00000462322 NBPF9Q3BBW0 867 aa29.85■■■□□ 2.37
SMKR1-201ENST00000462322 FGFR2P21802 821 aa29.84■■■□□ 2.37
SMKR1-201ENST00000462322 VEGFBP49765 207 aa29.84■■■□□ 2.37
SMKR1-201ENST00000462322 COPRSQ9NQ92 184 aa29.84■■■□□ 2.37
SMKR1-201ENST00000462322 CEP126Q9P2H0 1117 aa29.84■■■□□ 2.37
SMKR1-201ENST00000462322 FAM205AQ6ZU69 1335 aa29.84■■■□□ 2.37
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SMKR1-201ENST00000462322 IL15P40933 162 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
SMKR1-201ENST00000462322 MTX1Q13505 466 aa29.83■■■□□ 2.37
SMKR1-201ENST00000462322 TLL2Q9Y6L7 1015 aa29.83■■■□□ 2.37
SMKR1-201ENST00000462322 WNT10BO00744 389 aa29.82■■■□□ 2.36
SMKR1-201ENST00000462322 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
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SMKR1-201ENST00000462322 ITPRIPQ8IWB1 547 aa29.82■■■□□ 2.36
SMKR1-201ENST00000462322 LPIN2Q92539 896 aa29.82■■■□□ 2.36
SMKR1-201ENST00000462322 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
SMKR1-201ENST00000462322 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa29.81■■■□□ 2.36
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SMKR1-201ENST00000462322 BCAMP50895 628 aa29.81■■■□□ 2.36
SMKR1-201ENST00000462322 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
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SMKR1-201ENST00000462322 ATP2B3Q16720 1220 aa29.79■■■□□ 2.36
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SMKR1-201ENST00000462322 CDCA5Q96FF9 252 aa29.78■■■□□ 2.36
SMKR1-201ENST00000462322 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
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SMKR1-201ENST00000462322 GRM1Q13255 1194 aa29.75■■■□□ 2.35
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SMKR1-201ENST00000462322 PANK1Q8TE04 598 aa29.75■■■□□ 2.35
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SMKR1-201ENST00000462322 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
SMKR1-201ENST00000462322 RCAN3Q9UKA8 241 aa29.75■■■□□ 2.35
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SMKR1-201ENST00000462322 C1orf115Q9H7X2 142 aa29.73■■■□□ 2.35
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SMKR1-201ENST00000462322 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
SMKR1-201ENST00000462322 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
SMKR1-201ENST00000462322 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
SMKR1-201ENST00000462322 MVPQ14764 893 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
SMKR1-201ENST00000462322 AIDAQ96BJ3 306 aa29.63■■■□□ 2.33
SMKR1-201ENST00000462322 XAGE2Q96GT9 111 aa29.63■■■□□ 2.33
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