RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 RTL1A6NKG5 1358 aa5.7□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 TTC28Q96AY4 2481 aa5.7□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa5.7□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 TRAF5O00463 557 aa5.7□□□□□ -1.5
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ECHDC1-211ENST00000460558 USP17L10C9JJH3 530 aa5.69□□□□□ -1.5
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ECHDC1-211ENST00000460558 USP17L12C9JPN9 530 aa5.69□□□□□ -1.5
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ECHDC1-211ENST00000460558 USP17L18D6R9N7 530 aa5.69□□□□□ -1.5
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ECHDC1-211ENST00000460558 USP17L20D6RJB6 530 aa5.69□□□□□ -1.5
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ECHDC1-211ENST00000460558 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
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ECHDC1-211ENST00000460558 PLPP7Q8NBV4 271 aa5.69□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC4A9Q96Q91 983 aa5.69□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa5.69□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 HDAC9Q9UKV0 1011 aa5.69□□□□□ -1.5
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ECHDC1-211ENST00000460558 USPL1Q5W0Q7 1092 aa5.68□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa5.68□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 RNF135Q8IUD6 432 aa5.68□□□□□ -1.5
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ECHDC1-211ENST00000460558 CNKSR1Q969H4 720 aa5.68□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 ZIC5Q96T25 663 aa5.68□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa5.68□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 IL21Q9HBE4 155 aa5.68□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 RNF186Q9NXI6 227 aa5.68□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 NCOR1O75376 2440 aa5.68□□□□□ -1.5
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ECHDC1-211ENST00000460558 LAMB4A4D0S4 1761 aa5.67□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 CACNA1AO00555 2505 aa5.67□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 CCDC93Q567U6 631 aa5.67□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP5.67□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 DEPDC4Q8N2C3 294 aa5.67□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC6A16Q9GZN6 736 aa5.67□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF408Q9H9D4 720 aa5.67□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa5.67□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa5.67□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 ESPNB1AK53 854 aa5.66□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 FZD9O00144 591 aa5.66□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 EIF6P56537 245 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 HUNKP57058 714 aa5.66□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP5.66□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 C4orf48Q5BLP8 95 aa5.66□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 SYNE4Q8N205 404 aa5.66□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 JDP2Q8WYK2 163 aa5.66□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF516Q92618 1163 aa5.66□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 COG3Q96JB2 828 aa5.66□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 BRIP1Q9BX63 1249 aa5.66□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 GJA3Q9Y6H8 435 aa5.66□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 RASA1P20936 1047 aa5.65□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 EPS15P42566 896 aa5.65□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 CLDN10P78369 228 aa5.65□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 SWI5Q1ZZU3 235 aa5.65□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 EML3Q32P44 896 aa5.65□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 STYK1Q6J9G0 422 aa5.65□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 RGMBQ6NW40 437 aa5.65□□□□□ -1.5
ECHDC1-211ENST00000460558 ZBTB33Q86T24 672 aa5.65□□□□□ -1.5
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