RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413409.6

PTPRC-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,338 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-206ENST00000413409 PDIA6Q15084 440 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRC-206ENST00000413409 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRC-206ENST00000413409 NLRP10Q86W26 655 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRC-206ENST00000413409 CFHR5Q9BXR6 569 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRC-206ENST00000413409 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRC-206ENST00000413409 CEP290O15078 2479 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRC-206ENST00000413409 C6orf229H3BNL8 230 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRC-206ENST00000413409 CDC45O75419 566 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
PTPRC-206ENST00000413409 BECN1Q14457 450 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRC-206ENST00000413409 PROSER3Q2NL68 480 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRC-206ENST00000413409 TMC4Q7Z404 712 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRC-206ENST00000413409 SSH3Q8TE77 659 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRC-206ENST00000413409 ERBB4Q15303 1308 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRC-206ENST00000413409 COL4A1P02462 1669 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRC-206ENST00000413409 ANXA1P04083 346 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRC-206ENST00000413409 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
PTPRC-206ENST00000413409 POLA2Q14181 598 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRC-206ENST00000413409 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
PTPRC-206ENST00000413409 C22orf23Q9BZE7 217 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRC-206ENST00000413409 OSBPL3Q9H4L5 887 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRC-206ENST00000413409 EN2P19622 333 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
PTPRC-206ENST00000413409 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
PTPRC-206ENST00000413409 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRC-206ENST00000413409 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
PTPRC-206ENST00000413409 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRC-206ENST00000413409 SALL3Q9BXA9 1300 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRC-206ENST00000413409 RBM25P49756 843 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
PTPRC-206ENST00000413409 MTX1Q13505 466 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRC-206ENST00000413409 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRC-206ENST00000413409 OTOP1Q7RTM1 612 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRC-206ENST00000413409 LINS1Q8NG48 757 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRC-206ENST00000413409 TBC1D16Q8TBP0 767 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRC-206ENST00000413409 LRRCC1Q9C099 1032 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRC-206ENST00000413409 TRIM17Q9Y577 477 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRC-206ENST00000413409 UTYO14607 1347 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRC-206ENST00000413409 AOX1Q06278 1338 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRC-206ENST00000413409 DLL1O00548 723 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRC-206ENST00000413409 RAB11FIP3O75154 756 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRC-206ENST00000413409 SH3TC1Q8TE82 1336 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRC-206ENST00000413409 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
PTPRC-206ENST00000413409 GMLQ99445 158 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRC-206ENST00000413409 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRC-206ENST00000413409 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
PTPRC-206ENST00000413409 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRC-206ENST00000413409 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
PTPRC-206ENST00000413409 SREBF2Q12772 1141 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRC-206ENST00000413409 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
PTPRC-206ENST00000413409 EYA3Q99504 573 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRC-206ENST00000413409 MYOZ2Q9NPC6 264 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRC-206ENST00000413409 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 AGBL3Q8NEM8 1001 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF609O15014 1411 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 PDE1AP54750 535 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 TCIRG1Q13488 830 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 CUL9Q8IWT3 2517 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 NBPF9Q3BBW0 867 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 COPS6Q7L5N1 327 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 ARMC5Q96C12 935 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 OTUD5Q96G74 571 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 STAP2Q9UGK3 403 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 PTPN22Q9Y2R2 807 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 APBB1O00213 710 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 USP17L8P0C7I0 530 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 CAP1Q01518 475 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 NEXNQ0ZGT2 675 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 XAGE3Q8WTP9 111 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 COL6A3P12111 3177 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 H0YGN5 161 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 GRM8O00222 908 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 SRGAP3O43295 1099 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 MX1P20591 662 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 SPRYD7Q5W111 196 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 CASC1Q6TDU7 716 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 RIC3Q7Z5B4 369 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 SDSP20132 328 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 KIF1BPQ96EK5 621 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 FAM89AQ96GI7 184 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 PODXL2Q9NZ53 605 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 SLC4A3P48751 1232 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 PRKG1Q13976 671 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 LDLRAD1Q5T700 205 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRC-206ENST00000413409 NEURL1BA8MQ27 555 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRC-206ENST00000413409 UFL1O94874 794 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRC-206ENST00000413409 ALDH1A1P00352 501 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRC-206ENST00000413409 IGKV5-2P06315 115 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRC-206ENST00000413409 RPS8P62241 208 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
PTPRC-206ENST00000413409 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
PTPRC-206ENST00000413409 IFNL1Q8IU54 200 aa20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms