RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411660.1

RPS3AP25-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 25, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP25, Length 793 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP25-201ENST00000411660 PRSS36Q5K4E3 855 aa9.48□□□□□ -0.89
RPS3AP25-201ENST00000411660 KIAA0319Q5VV43 1072 aa9.48□□□□□ -0.89
RPS3AP25-201ENST00000411660 CCNJLQ8IV13 435 aa9.48□□□□□ -0.89
RPS3AP25-201ENST00000411660 TCF12Q99081 682 aa9.48□□□□□ -0.89
RPS3AP25-201ENST00000411660 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
RPS3AP25-201ENST00000411660 DUOXA2Q1HG44 320 aa9.47□□□□□ -0.89
RPS3AP25-201ENST00000411660 ACAD11Q709F0 780 aa9.47□□□□□ -0.89
RPS3AP25-201ENST00000411660 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
RPS3AP25-201ENST00000411660 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
RPS3AP25-201ENST00000411660 NIF3L1Q9GZT8 377 aa9.47□□□□□ -0.89
RPS3AP25-201ENST00000411660 DNAJC25Q9H1X3 360 aa9.47□□□□□ -0.89
RPS3AP25-201ENST00000411660 METTL12A8MUP2 240 aa9.46□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 C19orf57Q0VDD7 668 aa9.46□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 IKBKEQ14164 716 aa9.46□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 ASAP3Q8TDY4 903 aa9.46□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 UBASH3BQ8TF42 649 aa9.46□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 DMRTB1Q96MA1 342 aa9.46□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 ARL4DP49703 201 aa9.45□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 PRR23CQ6ZRP0 262 aa9.45□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 SLC7A3Q8WY07 619 aa9.45□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 A0A096LPE4 126 aa9.44□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 A0A1W2PPZ6 126 aa9.44□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 GLB1P16278 677 aa9.44□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 GRIA4P48058 902 aa9.44□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 TRAIPQ9BWF2 469 aa9.44□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 LIN7BQ9HAP6 207 aa9.44□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 SPRED3Q2MJR0 410 aa9.43□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 TMC1Q8TDI8 760 aa9.43□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 CCDC74AQ96AQ1 378 aa9.43□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 CSRNP1Q96S65 589 aa9.43□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 CEP41Q9BYV8 373 aa9.43□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 DCTN4Q9UJW0 460 aa9.43□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 MEGF11A6BM72 1044 aa9.42□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 NLRP12P59046 1061 aa9.42□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 KCNA1Q09470 495 aa9.42□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 TMC7Q7Z402 723 aa9.42□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 ARMC10Q8N2F6 343 aa9.42□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 NPHS2Q9NP85 383 aa9.42□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 ZNF423Q2M1K9 1284 aa9.41□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 DSC3Q14574 896 aa9.4□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 UVSSAQ2YD98 709 aa9.4□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa9.4□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 SLC51AQ86UW1 340 aa9.4□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 RUSC1Q9BVN2 902 aa9.4□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 NRSN2Q9GZP1 204 aa9.4□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 RNF208Q9H0X6 261 aa9.4□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa9.4□□□□□ -0.9
RPS3AP25-201ENST00000411660 ITPKAP23677 461 aa9.39□□□□□ -0.91
RPS3AP25-201ENST00000411660 PCDH1Q08174 1060 aa9.39□□□□□ -0.91
RPS3AP25-201ENST00000411660 Q8N3U1 123 aa9.39□□□□□ -0.91
RPS3AP25-201ENST00000411660 EHD4Q9H223 541 aa9.39□□□□□ -0.91
RPS3AP25-201ENST00000411660 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa9.38□□□□□ -0.91
RPS3AP25-201ENST00000411660 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
RPS3AP25-201ENST00000411660 ANKRD34AQ69YU3 496 aa9.38□□□□□ -0.91
RPS3AP25-201ENST00000411660 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
RPS3AP25-201ENST00000411660 GLIS3Q8NEA6 775 aa9.38□□□□□ -0.91
RPS3AP25-201ENST00000411660 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa9.38□□□□□ -0.91
RPS3AP25-201ENST00000411660 RAXQ9Y2V3 346 aa9.38□□□□□ -0.91
RPS3AP25-201ENST00000411660 DLGAP3O95886 979 aa9.37□□□□□ -0.91
RPS3AP25-201ENST00000411660 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
RPS3AP25-201ENST00000411660 ZNF576Q9H609 170 aa9.37□□□□□ -0.91
RPS3AP25-201ENST00000411660 ABCB6Q9NP58 842 aa9.37□□□□□ -0.91
RPS3AP25-201ENST00000411660 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa9.36□□□□□ -0.91
RPS3AP25-201ENST00000411660 DHX15O43143 795 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
RPS3AP25-201ENST00000411660 TREHO43280 583 aa9.36□□□□□ -0.91
RPS3AP25-201ENST00000411660 MAPK1P28482 360 aa9.36□□□□□ -0.91
RPS3AP25-201ENST00000411660 GSTM4Q03013 218 aa9.36□□□□□ -0.91
RPS3AP25-201ENST00000411660 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
RPS3AP25-201ENST00000411660 MYRFLQ96LU7 910 aa9.36□□□□□ -0.91
RPS3AP25-201ENST00000411660 SUGCTQ9HAC7 445 aa9.36□□□□□ -0.91
RPS3AP25-201ENST00000411660 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa9.35□□□□□ -0.91
RPS3AP25-201ENST00000411660 B3GALT4O96024 378 aa9.35□□□□□ -0.91
RPS3AP25-201ENST00000411660 FSTP19883 344 aa9.35□□□□□ -0.91
RPS3AP25-201ENST00000411660 PREPP48147 710 aa9.35□□□□□ -0.91
RPS3AP25-201ENST00000411660 PLCB3Q01970 1234 aa9.35□□□□□ -0.91
RPS3AP25-201ENST00000411660 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
RPS3AP25-201ENST00000411660 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
RPS3AP25-201ENST00000411660 USP26Q9BXU7 913 aa9.35□□□□□ -0.91
RPS3AP25-201ENST00000411660 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
RPS3AP25-201ENST00000411660 GRM2Q14416 872 aa9.34□□□□□ -0.91
RPS3AP25-201ENST00000411660 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
RPS3AP25-201ENST00000411660 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
RPS3AP25-201ENST00000411660 FAM20CQ8IXL6 584 aa9.34□□□□□ -0.91
RPS3AP25-201ENST00000411660 STOML1Q9UBI4 398 aa9.34□□□□□ -0.91
RPS3AP25-201ENST00000411660 TIAF1O95411 115 aa9.33□□□□□ -0.92
RPS3AP25-201ENST00000411660 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
RPS3AP25-201ENST00000411660 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
RPS3AP25-201ENST00000411660 XP32Q5T750 250 aa9.33□□□□□ -0.92
RPS3AP25-201ENST00000411660 TRAK1Q9UPV9 953 aa9.33□□□□□ -0.92
RPS3AP25-201ENST00000411660 SART1O43290 800 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
RPS3AP25-201ENST00000411660 NUTM2GQ5VZR2 741 aa9.32□□□□□ -0.92
RPS3AP25-201ENST00000411660 FDX2Q6P4F2 183 aa9.32□□□□□ -0.92
RPS3AP25-201ENST00000411660 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
RPS3AP25-201ENST00000411660 RNF112Q9ULX5 631 aa9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms