RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 MCAMP43121 646 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 LPIN2Q92539 896 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 SPTLC3Q9NUV7 552 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 MAST3O60307 1309 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 PI16Q6UXB8 463 aa22.02■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.02■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.02■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 M0R2C6 588 aa22■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 PHKA1P46020 1223 aa22■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC102BQ68D86 513 aa22■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 AMIGO3Q86WK7 504 aa22■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 DSCC1Q9BVC3 393 aa22■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 COL4A1P02462 1669 aa22■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 APBA3O96018 575 aa22■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 SLC5A1P13866 664 aa22■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 OSBP2Q969R2 916 aa22■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 ZPR1O75312 459 aa21.99■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 LARGE1O95461 756 aa21.99■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 TPM3P06753 285 aa21.99■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa21.99■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 RPS6KB1P23443 525 aa21.99■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 KRT32Q14532 448 aa21.99■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 KIF3AQ9Y496 699 aa21.99■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 C4BP0C0L5 1744 aa21.99■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 COL24A1Q17RW2 1714 aa21.99■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 SLC10A5Q5PT55 438 aa21.98■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 CYP21A2P08686 494 aa21.98■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 SNAP23O00161 211 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 SETDB2Q96T68 719 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 NYXQ9GZU5 481 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 WASHC4Q2M389 1173 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM87AQ8NBN3 555 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 APPBP2Q92624 585 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
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SPNS1-204ENST00000352260 CHRNDQ07001 517 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 CASZ1Q86V15 1759 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF710Q8N1W2 664 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 CAMKK2Q96RR4 588 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SPNS1-204ENST00000352260 MYH7P12883 1935 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 TAF3Q5VWG9 929 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 NEK1Q96PY6 1258 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 C4AP0C0L4 1744 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 BAG6P46379 1132 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 TCEANC2Q96MN5 208 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 LRRC4BQ9NT99 713 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 ANKRD1Q15327 319 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 ME3Q16798 604 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 RNF214Q8ND24 703 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 TPCN1Q9ULQ1 816 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 ADD2P35612 726 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 ST3GAL1Q11201 340 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 STOX1Q6ZVD7 989 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC83Q8IWF9 413 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 TRAPPC3LQ5T215 181 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 PROM2Q8N271 834 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 PLSCR1O15162 318 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 FOXP2O15409 715 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 RFC4P35249 363 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 SPATA5Q8NB90 893 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 A0A0G2JLW4 131 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-204ENST00000352260 RASGRF1Q13972 1273 aa21.91■■□□□ 1.1
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