RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332029.2

SOCS1-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS1, Length 1,225 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1-201ENST00000332029 EPHA10Q5JZY3 1008 aa26.71■■□□□ 1.87
SOCS1-201ENST00000332029 TAF7LQ5H9L4 462 aa26.7■■□□□ 1.86
SOCS1-201ENST00000332029 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.7■■□□□ 1.86
SOCS1-201ENST00000332029 MTMR14Q8NCE2 650 aa26.7■■□□□ 1.86
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
SOCS1-201ENST00000332029 DEFB129Q9H1M3 183 aa26.7■■□□□ 1.86
SOCS1-201ENST00000332029 ALDH1L1O75891 902 aa26.69■■□□□ 1.86
SOCS1-201ENST00000332029 SREBF2Q12772 1141 aa26.69■■□□□ 1.86
SOCS1-201ENST00000332029 LDLRAD1Q5T700 205 aa26.69■■□□□ 1.86
SOCS1-201ENST00000332029 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa26.69■■□□□ 1.86
SOCS1-201ENST00000332029 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
SOCS1-201ENST00000332029 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
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SOCS1-201ENST00000332029 SOX10P56693 466 aa26.68■■□□□ 1.86
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
SOCS1-201ENST00000332029 CNNM1Q9NRU3 951 aa26.68■■□□□ 1.86
SOCS1-201ENST00000332029 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa26.68■■□□□ 1.86
SOCS1-201ENST00000332029 E9PSI1 815 aa26.67■■□□□ 1.86
SOCS1-201ENST00000332029 PLIN1O60240 522 aa26.67■■□□□ 1.86
SOCS1-201ENST00000332029 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
SOCS1-201ENST00000332029 CFAP100Q494V2 611 aa26.67■■□□□ 1.86
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SOCS1-201ENST00000332029 JAG2Q9Y219 1238 aa26.67■■□□□ 1.86
SOCS1-201ENST00000332029 A0A1B0GUL6 1792 aa26.66■■□□□ 1.86
SOCS1-201ENST00000332029 FZD1Q9UP38 647 aa26.66■■□□□ 1.86
SOCS1-201ENST00000332029 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa26.66■■□□□ 1.86
SOCS1-201ENST00000332029 SPDYE2BA6NHP3 402 aa26.65■■□□□ 1.86
SOCS1-201ENST00000332029 MYO1BO43795 1136 aa26.65■■□□□ 1.86
SOCS1-201ENST00000332029 SPDYE6P0CI01 402 aa26.65■■□□□ 1.86
SOCS1-201ENST00000332029 SPRYD7Q5W111 196 aa26.65■■□□□ 1.86
SOCS1-201ENST00000332029 CLRN2A0PK11 232 aa26.64■■□□□ 1.86
SOCS1-201ENST00000332029 GPR25O00155 361 aa26.64■■□□□ 1.86
SOCS1-201ENST00000332029 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
SOCS1-201ENST00000332029 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
SOCS1-201ENST00000332029 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
SOCS1-201ENST00000332029 HPS5Q9UPZ3 1129 aa26.64■■□□□ 1.86
SOCS1-201ENST00000332029 SLFN5Q08AF3 891 aa26.63■■□□□ 1.85
SOCS1-201ENST00000332029 MAP3K11Q16584 847 aa26.63■■□□□ 1.85
SOCS1-201ENST00000332029 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
SOCS1-201ENST00000332029 SSC5DA1L4H1 1573 aa26.63■■□□□ 1.85
SOCS1-201ENST00000332029 CFHR5Q9BXR6 569 aa26.62■■□□□ 1.85
SOCS1-201ENST00000332029 VEZTQ9HBM0 779 aa26.62■■□□□ 1.85
SOCS1-201ENST00000332029 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
SOCS1-201ENST00000332029 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP26.61■■□□□ 1.85
SOCS1-201ENST00000332029 SLC10A4Q96EP9 437 aa26.61■■□□□ 1.85
SOCS1-201ENST00000332029 SUCLG2Q96I99 432 aa26.61■■□□□ 1.85
SOCS1-201ENST00000332029 AOX1Q06278 1338 aa26.61■■□□□ 1.85
SOCS1-201ENST00000332029 FAM205AQ6ZU69 1335 aa26.61■■□□□ 1.85
SOCS1-201ENST00000332029 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
SOCS1-201ENST00000332029 UBE4AQ14139 1066 aa26.6■■□□□ 1.85
SOCS1-201ENST00000332029 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa26.6■■□□□ 1.85
SOCS1-201ENST00000332029 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
SOCS1-201ENST00000332029 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
SOCS1-201ENST00000332029 SSH1Q8WYL5 1049 aa26.59■■□□□ 1.85
SOCS1-201ENST00000332029 KAZALD1Q96I82 304 aa26.59■■□□□ 1.85
SOCS1-201ENST00000332029 CLMNQ96JQ2 1002 aa26.59■■□□□ 1.85
SOCS1-201ENST00000332029 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa26.59■■□□□ 1.85
SOCS1-201ENST00000332029 PTPRCP08575 1304 aa26.59■■□□□ 1.85
SOCS1-201ENST00000332029 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
SOCS1-201ENST00000332029 FKTNO75072 461 aa26.58■■□□□ 1.85
SOCS1-201ENST00000332029 SLC34A2O95436 690 aa26.58■■□□□ 1.85
SOCS1-201ENST00000332029 ALDH1A1P00352 501 aa26.58■■□□□ 1.85
SOCS1-201ENST00000332029 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
SOCS1-201ENST00000332029 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
SOCS1-201ENST00000332029 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
SOCS1-201ENST00000332029 GYG1P46976 350 aa26.58■■□□□ 1.85
SOCS1-201ENST00000332029 MFSD14BQ5SR56 506 aa26.58■■□□□ 1.85
SOCS1-201ENST00000332029 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
SOCS1-201ENST00000332029 UTYO14607 1347 aa26.58■■□□□ 1.85
SOCS1-201ENST00000332029 INHBEP58166 350 aa26.57■■□□□ 1.84
SOCS1-201ENST00000332029 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
SOCS1-201ENST00000332029 CDCA7LQ96GN5 454 aa26.57■■□□□ 1.84
SOCS1-201ENST00000332029 WNK4Q96J92 1243 aa26.57■■□□□ 1.84
SOCS1-201ENST00000332029 ECM29Q5VYK3 1845 aa26.57■■□□□ 1.84
SOCS1-201ENST00000332029 UNCXA6NJT0 531 aa26.56■■□□□ 1.84
SOCS1-201ENST00000332029 RASA3Q14644 834 aa26.56■■□□□ 1.84
SOCS1-201ENST00000332029 IFNL1Q8IU54 200 aa26.56■■□□□ 1.84
SOCS1-201ENST00000332029 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
SOCS1-201ENST00000332029 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
SOCS1-201ENST00000332029 IREB2P48200 963 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
SOCS1-201ENST00000332029 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
SOCS1-201ENST00000332029 SERPINA10Q9UK55 444 aa26.55■■□□□ 1.84
SOCS1-201ENST00000332029 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa26.55■■□□□ 1.84
SOCS1-201ENST00000332029 MROH5Q6ZUA9 1318 aa26.55■■□□□ 1.84
SOCS1-201ENST00000332029 CCER2I3L3R5 266 aa26.54■■□□□ 1.84
SOCS1-201ENST00000332029 TNFAIP1Q13829 316 aa26.54■■□□□ 1.84
SOCS1-201ENST00000332029 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
SOCS1-201ENST00000332029 USP2O75604 605 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
SOCS1-201ENST00000332029 ALDH1L2Q3SY69 923 aa26.53■■□□□ 1.84
SOCS1-201ENST00000332029 SPDYE2Q495Y8 402 aa26.53■■□□□ 1.84
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
SOCS1-201ENST00000332029 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP26.52■■□□□ 1.84
SOCS1-201ENST00000332029 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
SOCS1-201ENST00000332029 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa26.52■■□□□ 1.84
SOCS1-201ENST00000332029 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
SOCS1-201ENST00000332029 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
SOCS1-201ENST00000332029 VPS37DQ86XT2 251 aa26.51■■□□□ 1.83
SOCS1-201ENST00000332029 GJA5P36382 358 aa26.5■■□□□ 1.83
SOCS1-201ENST00000332029 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
SOCS1-201ENST00000332029 ANKRD44Q8N8A2 993 aa26.5■■□□□ 1.83
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