RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000058860.13

Usf2-201, Transcript of Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Usf2, Length 2,419 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2-201ENSMUST00000058860 Shank3Q4ACU6 1730 aa22.13■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Anxa1P10107 346 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Golph3lQ8R088 285 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Kcnk13Q8R1P5 405 aa22.13■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Stk38Q91VJ4 465 aa22.13■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Acsbg1Q99PU5 721 aa22.13■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Clic4Q9QYB1 253 aa22.13■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Pard3Q99NH2 1333 aa22.13■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Nxf2Q4ZGD8 691 aa22.12■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Fsd2Q8BZ52 692 aa22.12■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Gigyf1Q99MR1 1044 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Brwd3A2AHJ4 1799 aa22.12■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Ltbp4Q8K4G1 1666 aa22.12■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Slu7Q8BHJ9 585 aa22.12■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Tpcn2Q8BWC0 731 aa22.12■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Q8BZJ8 459 aa22.12■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Sass6Q80UK7 654 aa22.11■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Kcnq5Q9JK45 933 aa22.11■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Cnpy2Q9QXT0 182 aa22.11■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Col3a1P08121 1464 aa22.11■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 ErmnQ5EBJ4 281 aa22.11■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Edrf1Q6GQV7 1239 aa22.11■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Cnot6lQ8VEG6 555 aa22.11■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Cep63Q3UPP8 700 aa22.1■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 ApobrQ8VBT6 942 aa22.1■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Yeats4Q9CR11 227 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Ccdc94Q9D6J3 314 aa22.1■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Nav1Q8CH77 1875 aa22.1■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Pramel3A2AHA7 463 aa22.1■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Gm7903A2AWL1 463 aa22.1■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 AV320801A2AWL3 467 aa22.1■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Gm15023L7MUB4 467 aa22.1■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Ccng2O08918 344 aa22.1■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Lrrc8aQ80WG5 810 aa22.1■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Ints4Q8CIM8 964 aa22.1■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Kcnq3Q8K3F6 873 aa22.1■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Mei1Q9D4I2 1268 aa22.1■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Znf326O88291 580 aa22.09■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Zkscan4Q5SZT6 480 aa22.09■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Zfp251Q6PCX8 632 aa22.09■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Odf2lQ9D478 642 aa22.09■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Tulp1Q9Z273 543 aa22.09■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Sptlc2P97363 560 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Nlrp9aQ66X03 949 aa22.09■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Emilin1Q99K41 1017 aa22.09■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Arap2Q8BZ05 1703 aa22.09■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Gm28047Q3US59 414 aa22.08■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Arid5bQ8BM75 1188 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Nlrp3Q8R4B8 1033 aa22.08■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Hps3Q91VB4 1002 aa22.08■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Riok1Q922Q2 567 aa22.08■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 Ube3bQ9ES34 1070 aa22.08■■□□□ 1.13
Usf2-201ENSMUST00000058860 PappaQ8R4K8 1624 aa22.08■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 CtifQ6PEE2 600 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 Alx1Q8C8B0 326 aa22.08■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 Dnaaf4Q8R368 420 aa22.08■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 Pcdhb22Q91XZ8 794 aa22.08■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 Nop2Q922K7 793 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 Gm20425E9Q035 978 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 SrprbP47758 269 aa22.07■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 XpcP51612 930 aa22.07■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 Il17raQ60943 864 aa22.07■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 Nip7Q9CXK8 180 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 Cyp2d9P11714 504 aa22.07■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 Pip4k2bQ80XI4 416 aa22.07■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 Brinp3Q499E0 766 aa22.06■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 Ube2oQ6ZPJ3 1288 aa22.06■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 Ift57Q8BXG3 429 aa22.06■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 Pcdhb9E9Q5G2 828 aa22.06■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 Cops6O88545 324 aa22.06■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 Luzp1Q8R4U7 1068 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 Gm43638A0A0J9YU36 694 aa22.05■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 Cyp3a59D3Z2W7 503 aa22.05■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 Prl3d1P18121 224 aa22.05■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 Zbtb38Q3LR78 1197 aa22.05■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 Zbtb43Q9DAI4 467 aa22.05■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 Myh7Q91Z83 1935 aa22.04■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 Sptlc3Q8BG54 563 aa22.04■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 Lipo1J3QME6 396 aa22.04■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 Metap2O08663 478 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 Prdm1Q60636 856 aa22.04■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 Tbc1d7Q9D0K0 293 aa22.04■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 Cyp26a1O55127 497 aa22.03■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 Sept1P42209 366 aa22.03■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 Itga6Q61739 1091 aa22.03■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 Kiaa0754Q69ZZ9 979 aa22.03■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 Zfp202Q8C879 641 aa22.03■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa22.03■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 CpdO89001 1377 aa22.03■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 Ssc5dQ8BV57 1371 aa22.03■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 Acap3Q6NXL5 833 aa22.02■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 Sil1Q9EPK6 465 aa22.02■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 Ms4a1P19437 291 aa22.02■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 Sec62Q8BU14 398 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 Stxbp4Q9WV89 557 aa22.02■■□□□ 1.12
Usf2-201ENSMUST00000058860 Me1P06801 572 aa22.01■■□□□ 1.11
Usf2-201ENSMUST00000058860 Pfkfb1P70266 471 aa22.01■■□□□ 1.11
Usf2-201ENSMUST00000058860 Acnat2Q8BGG9 420 aa22.01■■□□□ 1.11
Usf2-201ENSMUST00000058860 Prkag3Q8BGM7 489 aa22.01■■□□□ 1.11
Usf2-201ENSMUST00000058860 Sept12Q9D451 317 aa22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.9 ms