Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM7

Prkag3, 5'-AMP-activated protein kinase subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkag3Q8BGM7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
Prkag3Q8BGM7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Prkag3Q8BGM7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Prkag3Q8BGM7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Prkag3Q8BGM7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Prkag3Q8BGM7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Prkag3Q8BGM7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
Prkag3Q8BGM7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
Prkag3Q8BGM7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Prkag3Q8BGM7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Prkag3Q8BGM7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Prkag3Q8BGM7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
Prkag3Q8BGM7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Prkag3Q8BGM7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Prkag3Q8BGM7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Prkag3Q8BGM7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Prkag3Q8BGM7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Prkag3Q8BGM7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Prkag3Q8BGM7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Prkag3Q8BGM7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Prkag3Q8BGM7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Prkag3Q8BGM7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Prkag3Q8BGM7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Prkag3Q8BGM7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Prkag3Q8BGM7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Prkag3Q8BGM7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Prkag3Q8BGM7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Prkag3Q8BGM7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
Prkag3Q8BGM7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Prkag3Q8BGM7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Prkag3Q8BGM7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.14
Prkag3Q8BGM7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Prkag3Q8BGM7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Prkag3Q8BGM7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Prkag3Q8BGM7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Prkag3Q8BGM7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Prkag3Q8BGM7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Prkag3Q8BGM7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Prkag3Q8BGM7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Prkag3Q8BGM7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Prkag3Q8BGM7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Prkag3Q8BGM7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Prkag3Q8BGM7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Prkag3Q8BGM7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Prkag3Q8BGM7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Prkag3Q8BGM7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Prkag3Q8BGM7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Prkag3Q8BGM7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Prkag3Q8BGM7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Prkag3Q8BGM7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Prkag3Q8BGM7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Prkag3Q8BGM7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Prkag3Q8BGM7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Prkag3Q8BGM7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Prkag3Q8BGM7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Prkag3Q8BGM7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Prkag3Q8BGM7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Prkag3Q8BGM7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Prkag3Q8BGM7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Prkag3Q8BGM7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Prkag3Q8BGM7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
Prkag3Q8BGM7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Prkag3Q8BGM7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Prkag3Q8BGM7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Prkag3Q8BGM7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Prkag3Q8BGM7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Prkag3Q8BGM7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Prkag3Q8BGM7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Prkag3Q8BGM7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Prkag3Q8BGM7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Prkag3Q8BGM7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Prkag3Q8BGM7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
Prkag3Q8BGM7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Prkag3Q8BGM7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Prkag3Q8BGM7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Prkag3Q8BGM7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Prkag3Q8BGM7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Prkag3Q8BGM7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Prkag3Q8BGM7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Prkag3Q8BGM7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Prkag3Q8BGM7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Prkag3Q8BGM7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Prkag3Q8BGM7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Prkag3Q8BGM7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Prkag3Q8BGM7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Prkag3Q8BGM7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Prkag3Q8BGM7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Prkag3Q8BGM7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Prkag3Q8BGM7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Prkag3Q8BGM7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Prkag3Q8BGM7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Prkag3Q8BGM7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Prkag3Q8BGM7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Prkag3Q8BGM7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Prkag3Q8BGM7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Prkag3Q8BGM7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Prkag3Q8BGM7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Prkag3Q8BGM7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Prkag3Q8BGM7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Prkag3Q8BGM7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms