RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589050.1

RPRD1A-208, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1A, human

TSL 1 (best)

Gene RPRD1A, Length 1,022 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPRD1A-208	ENST00000589050		A0A0A6YYD4	124 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	GPR37	O15354	613 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	TGFA	P01135	160 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	FOSL1	P15407	271 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	RAB6A	P20340	208 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	SCAND1	P57086	179 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	EDDM3A	Q14507	147 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	CD276	Q5ZPR3	534 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	PTX4	Q96A99	478 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	POM121	Q96HA1	1249 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	PPA2	Q9H2U2	334 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	ETV7	Q9Y603	341 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	C22orf46	C9J442	243 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050		H3BUI4	141 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	MGST3	O14880	152 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	FUT3	P21217	361 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	SOX6	P35712	828 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	VEGFC	P49767	419 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	EDDM3B	P56851	147 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	RAB12	Q6IQ22	244 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	BRICD5	Q6PL45	260 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	TMEM186	Q96B77	213 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	CD5L	O43866	347 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	PDCD6	O75340	191 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	FAM189A2	Q15884	450 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	NEK7	Q8TDX7	302 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	SMR3A	Q99954	134 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	MMP26	Q9NRE1	261 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	ING3	Q9NXR8	418 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	SPATA2	Q9UM82	520 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	ITPR3	Q14573	2671 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050		A0A1W2PQ09	198 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	SOCS1	O15524	211 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	CSN2	P05814	226 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	CHAT	P28329	748 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	KCNJ3	P48549	501 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	PAX2	Q02962	417 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	AES	Q08117	197 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	BIVM	Q86UB2	503 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	AP3S1	Q92572	193 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	UBE2QL1	A1L167	161 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	FUOM	A2VDF0	154 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	LY6G6D	O95868	133 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPRD1A-208	ENST00000589050	GLA	P06280	429 aa		12.78	□□□□□ -0.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.6 ms